Белки ядерного матрикса, специфически связывающиеся с сателлитными ДНК Лобов, Иван Борисович

Краткое описание

Лобов,ИванБорисович.Белкиядерногоматрикса,специфическисвязывающиесяссателлитнымиДНК: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.25. - Санкт-Петербург, 1999. - 120 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ Н а правах рукописиЛОБОВИванБорисовичБЕЛКИЯДЕРНОГОМАТРИКСА,СПЕЦИФИЧЕСКИСВЯЗЫВАЮЩИЕСЯССАТЕЛЛИТНЫМИДНК. УДК 576.315.4; 576.316.32 специальность: 03.00.25 - клеточная биология ДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой степени кандидата биологических наук Н А

стр. 2
последовательности 2. Выделение плазмиднойДНК, электрофорез Д Н К и введение кощевой метки в Д Н К 3. Вьщеление ядер иядерногоматриксаиз клеток печени 4. Экстракциябелковядерногоматриксаи ионообменная хроматографиябелковна ОЕАЕ- и СМ-сефарозе 5. Метод замедления в геле и выявлениеспецифическихантител

стр. 8
структуры гетерохроматина. Конкретные задачи настоящей р а б о т ы состояли в следующем: 1. Разработать метод частичной солюбилизацииядерногоматриксав условиях, не приводящих к денатурациибелков. 2. Идентифицироватьбелкиядерногоматрикса,специфическисвязывающиесяс мажорным сателлитом мыши. 3. Сравнить

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Лобов, Иван Борисович
ОГЛАВЛЕНИЕ
Стр.
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. История открытия сателлитных ДНК
2. Организация стДНК
3. Эволюция стДНК
4. Роль стДНК в формировании центромера
5. Примеры консервативности последовательностей стДНК
6. Белки, специфически связывающиеся с стДНК
7. Консервативность структуры стДНК
8. Эпигенетические механизмы формирования гетерохромашна и центромера
9. Эффект положения и эктопическая конъюгация
10. Ядерный матрикс и скэффолд. Ассоциация стДНК с ядерным матриксом и скэффолдом
11. МАК/БАЯ-элементы. Белки, связывающиеся с МАИ/ЗАЯ-элементами
12. Вероятные функции стДНК
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1.Клонированные последовательности
2. Выделение плазмидной ДНК, электрофорез ДНК и введение концевой метки в ДНК
3. Выделение ядер и ядерного матрикса из клеток печени
4. Экстракция белков ядерного матрикса и ионообменная хроматография белков на БЕАЕ- и СМ-сефарозе
5. Метод замедления в геле и выявление специфических антител при помощи метода замедления в геле
6. ДНК-футпринтинг
7. Получение антител к ДНК-белковым комплексам
8. Окрашивание белков в полиакриламидном геле
9. Иммуноблотшнг
10. Аффинная очистка антител
11. Саузвестерн-блотшнг
12. Иммунофлуоресцентное окрашивание и гибридизация in situ
13. Определение величины изгиба фрагментов ДНК
14. Другие методы
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
1. Выявление ДНК-связывающей активности, специфичной к мажорному сателлиту мыши
2. Идентификация белка, специфически связывающегося с мажорным сателлитом
3. Факторы, обусловливающие специфичность связывания р 120 с ДНК мажорного сателлита
4. Определение участков связывания р 120 в составе мажорного сателлита
5. Идентичность р 120 белку ядерного матрикса и скэффолда
SAF-A/SP120/hnRNP-U
6. Специфичность связывания белков ядерного матрикса с мажорным сателлитом и MAR гена иммуноглобулина к мыши
7. Специфичность связывания белков ядерного матрикса с центромерными и прицентромерными стДНК мыши и человека
8. Определение внутриклеточной локализации р 120
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ
стДНК - сателлитная ДНК п.н. - пар нуклеотидов т.п.н. - тысяч пар нуклеотидов
MAR (Matrix Associated Regions) - участки ДНК, связанные с ядерным матриксом
SAR (Scaffold Attachment Regions) - участки ДНК, связанные со скэффолдом
интерфазных и митотических хромосом
БСА - бычий сывороточный альбумин
EDTA - этилендиамин тетрауксусная кислота
SDS - додецилсульфат натрия