Частота обменов при конъюгационной рекомбинации у escherichia coli К-12 и структура белка reca Бахланова, Ирина Витальевна

Краткое описание

Бахланова,ИринаВитальевна.ЧастотаобменовприконъюгационнойрекомбинацииуescherichiacoliК-12иструктурабелкаreca: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.15. - Санкт-Петербург, 1999. - 94 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 2
Глава 1. О Б З О Р Л И Т Е Р А Т У Р Ы 1.1.БелокR O C A B ГОМОЛОГИЧНОЙ 5 6 9рекомбинации9 9 10 1.1.1. Бактериальная конъюгация 1.1.2. Гомологичнаярекомбинацияу бактерий 1.1.3. Центральная рольбелкаR e c A в гомологичнойрекомбинации1.1.4.СтруктурабелкаR e c A из Е.coli(ROCAEC) 15 20 1.1.5.

стр. 4
расщеплениябелкаL e x A 3.3. Р е к о м б и н а ц и о н н ы е свойства х и м е р н ы хбелковR e c A (Р. Е.coli) 3.3.1.Частотарекомбинационныхобменов, контролируемых х и м е р н ы м ибелками3.3.2. Конститутивное в ы р а ж е н и е SOS-функций, к о н т р о л и р у е м ы х х и м е р н ы м ибелками

стр. 8
индукцией бильность в клетках в клетках Е. соН. Показано, что о н и не с в я з а н ы с Е . соИ S O S - ф у н к ц и й .белкаRecAПредполагается, кпричто ста­ пре­ филаментачастотуотноситсяобменовсвойствам, допределяющимрекомбинации. инициированияконъюгационнойМ а т е р и а л ы диссертации о

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Бахланова, Ирина Витальевна
Список сокращений.
ВВЕДЕНИЕ.
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1.1. Белок RecAB гомологичной рекомбинации.
1.1.1. Бактериальная конъюгация.
1.1.2. Гомологичная рекомбинация у бактерий.
1.1.3. Центральная роль белка RecA в гомологичной рекомбинации.
1.1.4. Структура белка RecA из Е. coli (RecAEc).
1.1.5. Частота рекомбинационных обменов на единицу длины ДНК.
1.2. SOS-система у бактерий.
1.2.1. Роль белка RecA в SOS-системе клетки.
1.2.2. Мутации гена гесА из Е. coli (гесАЕс) с конститутивным выражением SOS-функций.
1.3. RecA-подобныв белки у прокариот.
1.4. Структурно-функциональный анализ белка RecA с помощью химер.
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Бактериальные штаммы и плазмиды.
2.2. Среды.
2 3. Манипуляции с ДНК.
2.4. Статистическая обработка результатов.
2.5. Определение внутриклеточного уровня белка RecA.
2.6. Рекомбинационный тест.
2.7. Определение частоты рекомбинационных обменов.
2.8. Репарационный тест.
2.9. W-реактивация фага A.CI857.
2.10. SOS-хромотест.
2.11. Выделение и очистка белка LexA из Е. coli.
2.12. Реакция расщепления белка LexA.
2.13. Определение нуклеотидной последовательности ДНК.
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.
3.1. Структурно-функциональный анализ генов гесА из
Serratia marcescens Sb и Escherichia coli K-12.
3.1.1. Клонирование гена гесА из Serratia marcescens Sb (recASm)
3.1.2. Сравнение нуклеотидных последовательностей генов recAsm и recÄEc.
3.1.3. Сравнение аминокислотных последовательностей белков RecAsm и RecAEc.
3.1.4. Функциональные характеристики гена recASm.
3.2. Повышенная частота рекомбинационных обменов (ЧРО), контролируемых белком RecA из Pseudomonas aeruginosa в клетках Е. coli.
3.2.1. Белок RecApa повышает ЧРО без индукции SOS-системы в клетках Е. coli.
3.2.2. Мутация 1ехАЗ не влияет на повышение ЧРО, контролируемых белком RecApa.
3.2.3. Белок RecAPa стимулирует расщепление белка LexAEc.
3.2.4. Белок SSB ингибирует реакцию расщепления белка LexA.
3.3. Рекомбинационные свойства химерных белков RecA (P. aeruginosa/ Е. coli).
3.3.1. Частота рекомбинационных обменов, контролируемых химерными белками.
3.3.2. Конститутивное выражение SOS-функций, контролируемых химерными белками.
3.4. Генетические и физиологические факторы, влияющие на частоту рекомбинационных обменов.
3.4.1. Генетические факторы.
3.4.2. Физиологические факторы.
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
4.1. Области белка RecA, замены аминокислот в которых не влияют на ЧРО.
4.2. Области белка RecA, замены аминокислот в которых приводят к повышению ЧРО, сопряженному с конститутивным выражением SOS-функций.
4.3. Области белка RecA, замены аминокислот в которых влияют на ЧРО в отсутствие конститутивного выражения SOS-функций.
ВЫВОДЫ.