Дивергентные митогеномы беспозвоночных животных Николаева Ольга Владимировна

Краткое описание

Николаева,ОльгаВладимировна.Дивергентныемитогеномыбеспозвоночныхживотных: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.09 /НиколаеваОльгаВладимировна; [Место защиты: ФГБОУ ВО «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова»]. - Москва, 2022. - 151 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ имени М.В. ЛОМОНОСОВА НИИ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ имени А. Н. БЕЛОЗЕРСКОГО На правах рукописиНиколаеваОльгаВладимировнаДивергентныемитогеномыбеспозвоночныхживотных03.01.09 Математическая биология, биоинформатика ДИССЕРТАЦИЯ на соискание ученой степени

стр. 6
для филогенетического анализа вызывают т. н. диверегныемитогеномы те, эволюция которых проходила быстрее, чеммитогеномов«в среднем». Целью данной работы является изучение структурных и эволюционных особенностейдивергентныхмитогеномовбеспозвоночныхживотныхи применимости различных типов анализа

стр. 45
главных цепях обеспечивает отрицательное АТсмещение и положительное GC-смещение у киноринх, как и у большинства видовживотных.МитогеномыP. kielensis и E. svetlanae содержат типичный дляживотныхнабор из 37 генов (13 белок-кодирующих генов, 22 гена тРНК и 2 гена рРНК) и по одному дополнительному гену

Оглавление диссертациикандидат наук Николаева Ольга Владимировна
ОГЛАВЛЕНИЕ
УСЛОВНЫЕ СОКРАЩЕНИЯ
ВВЕДЕНИЕ
ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Структура митохондриального генома
1.1.1 Митохондриальная ДНК
1.1.2 Особенности организации митохондриальных геномов животных
1.2 Молекулярные маркеры для филогенетической реконструкции
1.3 Модели замещения в митогеномике
1.4 КтогЬупсЬа
1.4.1 Образ жизни и экология
1.4.2 Морфология
1.4.3 Таксономия и систематика
1.4.4 Ископаемые киноринхи
1.5 КешаШшогрЬа
1.5.1 Образ жизни и экология
1.5.2 Морфология
1.5.3 Таксономия и систематика
1.6 Orthonectida и Dicyemida - загадочные паразиты беспозвоночных
1.6.1 ОгШопесйёа
1.6.2 Бюуеш1ёа
1.6.3 Филогения ОгШопесйёа и Б1суеш1ёа 30 ЧАСТЬ II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Сбор материала и выделение ДНК
2.2 Секвенирование, сборка и аннотация митохондриальных геномов
2.3 Секвенирование РНК
2.4 Обогащение нативной митохондриальной ДНК волосатиков инвертированными повторами
2.5 Анализ инвертированных повторов в митохондриальных
геномах волосатиков
2.6 Определение первичной последовательности некодирующего региона
в митогеноме ¡пОЫа 1тг1
2.7 Определение нуклеотидного состава митохондриальных геномов
2.8 Анализ порядка генов
2.9 Филогенетический анализ
2.10 Поиск синапоморфий и оценка вероятности их приобретения и потери 40 ЧАСТЬ III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Структурная организация митохондриальных геномов
3.1.1 Киноринхи Echinoderes svetlanae и Pycnophyes kielensis
3.1.1.1 Общая организация
3.1.1.2 Порядок генов
3.1.1.3 Дуплицированные гены метиониновых тРНК
3.1.2 Волосатики Gordionus alpestris, Gordionus woherstorffii, Gordius sp. и Chordodes sp
3.1.2.1 Общая организация
3.1.2.2 Порядок генов
3.1.2.3 Кодирующие палиндромы
3.1.2.4 Эволюция порядка генов в митогеномах Ecdysozoa
3.1.3 Ортонектида Intoshia linei
3.1.3.1 Общая организация
3.1.3.2 Порядок генов
3.1.3.3 Транскрипция митохондриальных генов
3.1.3.4 Число ридов кДНК митохондриальных белок-кодирующих генов
3.1.4 Дициемида Dicyema sp
3.1.4.1 Общая организация
3.2 Филогенетический анализ
3.2.1 Белок-кодирующие гены
3.2.1.1 Ecdysozoa
3.2.1.2 Lophotrochozoa
3.2.2 Синапоморфии
3.2.2.1 Синапоморфии порядка генов
3.2.2.2 Синапоморфии в аминокислотных последовательностях 104 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 112 ВЫВОДЫ 114 Список литературы