Двойные и тройные спирали олигодезоксирибонуклеотидов с параллельной ориентацией цепей Щелкина, Анна Кирилловна

Краткое описание

Щелкина,АннаКирилловна.Двойныеитройныеспиралиолигодезоксирибонуклеотидовспараллельнойориентациейцепей: диссертация ... доктора физико-математических наук : 03.00.03. - Москва, 1997. - 229 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 2
им. в . А. ЭНГЕЛЬГАРДТА РОССИЙСКОЙ А К А Д Е М И И Н А У К Н а правах рукописиЩЕЛКИНААННАКИРИЛЛОВНАДВОЙНЫЕИТРОЙНЫЕСПИРАЛИС ОЛИГОДЕЗОКИРИБОНУКЛЕОТИДОВ С ПАРАЛЛЕЛБНОЙОРИЕНТАЦИЕЙЦЕПЕЙСпециальность 03. 00. 03 - Молекулярная биология Д и с с е р т а ц и я на соискание ученой степени доктора физико-математических

стр. 3
27 16 21 23 13 Г Л А В А П.Параллельныедвойныеспиралиолигодезоксирибонуклеотидов§ П . 1 .ПараллельныеД Н К с А Т парами оснований § II.2.ПараллельныеД Н К смешанного природного A T / G C состава § П.З. Особенности связывания лигандов с п а р Д Н К §11.3.1. Олигопептидные антибиотики в бороздках

стр. 32
внутримолекулярности структуры вышеперечисленными методами. 32 Г Л А В А IIПАРАЛЛЕЛЬНЫЕДВОЙНЫЕСПИРАЛИОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДОВВпервыедвойныеспиралиспараллельнойориентациейцепейнаблюдали в кислых растворах polyrA (Rich et al., 1961), a т а к ж е polyC (Langridge and Rich, 1963), d(GC) (Cruse

Оглавление диссертациидоктор физико-математических наук Щелкина, Анна Кирилловна
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА I. Экспериментальные подходы к получению и исследованию
высокоэнергетических форм ДНК
§1.1. Методы характеризации равновесных форм в растворах
олигонуклеотидов
§ 1.1.1 Время вращательной релаксации или
гидродинамический объем олигонуклеотида
§ 1.1.2 Определение доли неспаренных оснований
§ 1.1.3 Определение взаимной ориентации нитей
§1.2. Экспериментальные условия, способствующие образованию
внутримолекулярных структур
§ 1.2.1 Оптимальный диапазон концентраций
§ 1.2.2 Тип и концентрация противоионов
ГЛАВА II. Параллельные двойные спирали олигодезоксирибонуклеотидов
§ II.1. Параллельные ДНК с АТ парами оснований
§ II.2. Параллельные ДНК смешанного природного AT/GC состава
§ II.3. Особенности связывания лигандов с парДНК
§11.3.1. Олигопептидные антибиотики в бороздках парДНК
. §11.3.1.1 Стехиометрия связывания
§11.3.1.2..Сродство бороздочных лигандов к
параллельному TATA участку
§11.3.1.3.Доказательство сохранения параллельной ориентации нитей в комплексе парДНК psN 1 :дистамицинА
§11.3.2. Стабилизация дистамицином необычной АРС
конформации ДНК
§11.3.3. Интеркаляторы как зонды вторичной структуры
парДНК
§ II.4. Параллельная ДНК в условиях пониженной активности воды
§ II.5. Стабильность пар ДНК с isoG-C и G-5Met-isoC парами
Выводы главы II
ГЛАВА III. Параллельные (рекомбинантные) триплексы
олигодезоксирибонуклеотидов
§ III. 1. Классификация триплексов, экспериментальная модель
§ III.2. Термодинамика образования параллельных триплексов
§ III.3. Способы стабилизации R-формы ДНК
§ III.4. Узнавание фрагмента нативной ДНК олигонуклеотидом при
помощи получения межмолекулярного параллельного триплекса
Выводы главы III
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ. Описание формализма модели многих состояний перехода
спираль-клубок
СПИСОК ОСНОВНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ
ЛИТЕРАТУРА