Генетический и молекулярно-биологический анализ функций гена HSM2 в репарации предмутационных повреждений ДНК у дрожжей Saccharomyces cerevisiae Алексеев, Сергей Юрьевич

Краткое описание

Алексеев,СергейЮрьевич.Генетическийимолекулярно-биологическийанализфункцийгенаHSM2врепарациипредмутационныхповрежденийДНКудрожжейSaccharomycescerevisiae: диссертация ... кандидатабиологическихнаук : 03.00.15. - Санкт-Петербург, 1999. - 160 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
ПЕТЕРБУРГСКИЙ ИНСТИТУТ ЯДЕРНОЙ Ф И З Ж И ИМЕНИ Б.П. КОНСТАНТИНОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК На правах рукописиАЛЕКСЕЕВСергейЮрьевичГЕНЕТИЧЕСКИЙИМОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИИАНАЛИЗФУНКЦИЙГЕНАHSM2В РЕПАРАЦРШПРЕДМУТАЦИОННЫХПОВРЕЖДЕНИЙДНКУ ]1^0ЖШЕШSACCHAROMYCESCEREVISIAE. Специальность: 03.00.15 - генетика Диссертация на соискание з^ченой степени кандидатабиологическихнаук Научный...

стр. 6
генаPMS1 врепарациипредмутационныхповрежденийпри УФ-облучении 6.7. Совместное участие продуктовгеновHSM2и HSM3 врепарациипредмутационныхповреждений6.8.Репарацияпредмутационныхповрежденийс участием продуктагенаHSM2как новый пример участия КОСО в процессах рекомбинации ВЫВОДЫ СПИСОК

стр. 128
схемы, не противоречит ей и связан, видимо с пока не установленнымифункциямипродуктагенаHSM2. Следовательно, данная схема может быть применена для описания функционирования продуктагенаHSM2врепарациипредмутационныхповреждений. 6.6. Участие продуктагенаPMS1 врепарациипредмутационныхповрежденийпри УФ-облучении. Возникающие при образовании D-петель ошибочно спаренные основания, в принципе (рис. 14,...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Алексеев, Сергей Юрьевич
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА 1. СИСТЕМЫ ПОДЕРЖАНИЯ СТАБИЛЬНОСТИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО МАТЕРИАЛА У ДРОЖЖЕЙ SACCHAROMYCE CEREVISIAE (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ).
1.1. Основные типы повреждений ДНК и пути их репарации.
1.2. Типы взаимодействий между мутациями радиочувствительности. Эпистатические группы генов.
1.3. Эксцизионная репарация нуклеотидов (Эпистатическая группа ДАрЗ).
1.4. Пострепликативная репащ$ия (Эпистатическая группа RAD6).
1.5. Рекомбинационная репарация (Эпистатическая группа RAD52).
1.6. Эксцизионная репарация оснований.
1.7. Коррекция ошибочно спаренных оснований.
1.7.1. Роль коррекции ошибочно спаренных оснований. Универсальная система коррекции ошибочно спаренных оснований.
1.7.2. Прочие системы коррекции ошибочно спаренных оснований. HIM и HSM гены.
1.7.3. Способы экспериментальной регистрации нарушения коррекции ошибочно спаренных оснований.
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Список сокращенных названий веществ и буферных растворов.
2.2. Основные штаммы и условия их культивирования.
2.2.1. Обозначения генотипов дрожжей.
2.2.2. Штаммы.
2.2.3. Состав питательных сред и условия культивирования штаммов, использованных в работе.
2.3. Методы.
2.3.1. Осаждение ДНК этанолом.
2.3.2. Аналитический электрофорез с выделением ДНК в лунках.
2.3.3. Выделение небольших количеств двуцепочечной плазмидной ДНК из Е. coli кипячением.
2.3.4. Выделение больших количеств двуцепочечной плазмидной ДНК из Е. coli методом щелочного лизиса.
2.3.5. Выделение ДНК из дрожжей при переносе челночных плазмид в Е. coli.
2.3.6. Выделение одноцепочечной плазмидной ДНК.
2.3.7. Наработка бактериофага-помощника М13К в больших количествах.
2.3.8. Секвенирование ДНК.
2.3.9. Трансформация Е. coli.
2.3.10. Трансформация S. cerevisiae.
2.3.11. Микроманипулирование и тетрадный анализ.
2.3.12. Учет частоты спонтанных мутаций канаванинустойчивости.
2.3.13. УФ-облучение суспензии клеток.
2.3.14. Учет выживаемости при УФ-облучении.
2.3.15. Учет частоты появления мутантов при УФ-облучении культуры дрожжей.
2.3.16. Качественная оценка мутаторности по частоте прямых мутаций канаванинустойчивости.
2.3.17. Качественная оценка чувствительности к метилметансульфонату.
2.3.18. Стандартные молекулярно-биологические и микробиологические методы.
2.3.19. Статистические методы обработки результатов.
ГЛАВА 3. СОЗДАНИЕ СИСТЕМЫ ОЦЕНКИ ЭФФЕКТИВНОСТИ И
НАПРАВЛЕНИЯ КОРРЕКЦИИ ОШИБОЧНО СПАРЕННЫХ ОСНОВАНИЙ.
3.1. Конструирование плазмид с однонуклеотидными заменами в гене АОЕ2.
3.2. Конструирование плазмид, содержащих ошибочно спаренные основания.
ГЛАВА 4. КАРТИРОВАНИЕ ГЕНА ШМ2.
4.1. Хромосомная локализация гена НБМ2.
4.2. Картирование гена ШМ2 относительно маркеров правого плеча хромосомы IV.
ГЛАВА 5. СВОЙСТВА МУТАЦИИ 11зт2.
5.1. Влияние мутации 11зт2 на коррекцию искусственных гетеродуплексов и спонтанный мутагенез.
5.1.1. Эффективность и преимущественное направление коррекции использованных в работе искусственных гетеродуплексов в штамме дикого типа.
5.1.2. Влияние мутации 1т8гп2 на эффективность коррекции искусственных гетеродуплексов.
5.1.3. Влияние мутации hsm2 на преимущественное направление коррекции искусственных гетеродуплексов.
5.1.4. Взаимодействие мутаций hsm.2 и мутации pmsl при коррекции ошибочно спаренных оснований.
5.1.5. Влияние мутации hsm2 на спонтанный мутагенез. Взаимодействие мутаций hsm2 и мутации pmsl при спонтанном мутагенезе.
5.2. Взаимодействие мутации hsm2 с мутациями в генах других систем репарации ДНК при УФ-облучении и при обработке метилметансульфонатом.
5.2.1. Влияние мутации hsm2 на чувствительность к УФ-облучению и ММС и на и УФ-индуцированный мутагенез.
5.2.2. Взаимодействие мутаций hsm2 и rad2.
5.2.3. Взаимодействие мутаций hsm2 и rev3.
5.2.4. Взаимодействие мутаций hsm2 и rad54.
5.2.5. Взаимодействие мутаций hsm2 и pmsl.
5.2.6. Взаимодействие мутации hsm2 и hsm3.
ГЛАВА 6. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
6.1. Система оценки эффективности и направления коррекции ошибочно спаренных оснований.
6.2. Новые аспекты коррекции ошибочно спаренных оснований у S. cerevisiae.
6.3. Влияние мутации hsm2 на коррекцию ошибочно спаренных оснований в плазмидах. Роль продукта гена HSM2 в коррекции ошибочно спаренных оснований.
6.4. Участие продукта гена HSM2 в репарации предмутационных повреждений, возникающих в результате работы "склонной к ошибкам" репарации".
6.5. Гипотетическая схема механизма репарации предмутационных повреждений, возникающих при обходе некодирующих повреждений ДНК с участием продукта гена HSM2.
6.6. Участие продукта гена PMS1 в репарации предмутационных повреждений при УФ-облучении.
6.7. Совместное участие продуктов генов HSM2 и HSM в репарации предмутационных повреждений.
6.8. Репарация предмутационных повреждений с участием продукта гена HSM2 как новый пример участия КОСО в процессах рекомбинации.
ВЫВОДЫ.