Исследование двухкомпонентных белковых сигнальных систем: комплекс сенсорного родопсина с трансдюсером NpSRII/NpHtrII Рижиков Юрий Леонидович

Краткое описание

Рижиков,ЮрийЛеонидович.Исследованиедвухкомпонентныхбелковыхсигнальныхсистем:комплекссенсорногородопсинастрансдюсеромNpSRII/NpHtrII: диссертация ... кандидата физико-математических наук : 03.01.02 /РижиковЮрийЛеонидович; [Место защиты: ФГАОУ ВО «Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)»]. - Москва, 2020. - 158 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
исследовательский университет)» На правах рукописиРижиковЮрийЛеонидовичИсследованиедвухкомпонентныхбелковыхсигнальныхсистем:комплекссенсорногородопсинастрансдюсеромNpSRII/NpHtrII Специальность 03.01.02 - Биофизика Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Научный

стр. 2
ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР ................................................................................... 11 1.1Двухкомпонентныебелковыесигнальныесистемы............................................................... 11 1.2КомплекссенсорногородопсинаII с его родственнымтрансдюсером................................ 24 1.3 Методы решения пространственной структурыбелковс высоким разрешением............... 30 1.4 Метод...

стр. 141
исследованиепосвящено изучению структуры трансмембранных рецепторов (первых компонентов)двухкомпонентныхсистемна примерекомплексасенсорногородопсина2 странсдюсеромиз Natronomonas pharaonis. Цель работы заключалась в получении структуры фоторецепторногокомплексаNpSRII/NpHtrII с помощью метода малоуглового

Оглавление диссертациикандидат наук Рижиков Юрий Леонидович
СОДЕРЖАНИЕ ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
1.1 Двухкомпонентные белковые сигнальные системы (ТСБб)
1.2 Комплекс сенсорного родопсина II (^р8М1) с его родственным трансдюсером
1.3 Методы решения пространственной структуры белков ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Приготовление образцов
2.1.1 Трансформация плазмиды и белковая экспрессия
2.1.2 Хроматография
3.1.3 Сборка нанодисков и реконституция мембранных белков
2.2 Метод малоуглового рассеяния
2.2.1 Общие сведения
2.2.2 Малоугловое рассеяние рентгеновских лучей и нейтронов
2.2.3 Методы интерпретации малоугловых данных 2.2.3.1 Корреляционная функция плотности
2.2.3.2 Инварианты рассеяния 2.2.3.4 Метод вариации контраста
2.3 Установки малоуглового рассеяния
2.3.1 BM29, синхротрон ESRF
2.3.2 ЮМО, ИБР-2, ОИЯИ
2.3.3 Ригаку, МФТИ
ГЛАВА 3. Методические особенности применения метода малоуглового рассеяния для структурных исследований мембранных белков на примере комплекса
3.1 Учёт влияния детергентного пояса при обработке данных МУР
3.2 Учёт влияния наличия олигомеров разного порядка при обработке данных Выводы главы
ГЛАВА 4. Исследование комплекса солюбилизированного в
детергенте
4.1 Димеризация NpSRII/NpHtrII, сосотояние частичной разупорядоченности и применение модели гибких шарниров для описания пространственной конфигурации трансдюсера
4.2 Исследование влияния ионной силы раствора на конформацию и олигомерное состояние NpSRII/NpHtrII солюбилизированного в детергенте (ОБМ)
4.3 Модель высокого разрешения тримера димеров NpSRII/NpHtrII
4.4 Обобщение результатов обработки данных МУР для комплекса NpSRII/NpHtrII солюбилизированного в детергенте
4.5 Негативное контрастирование для ^р8М1/^рН1:г11 солюбилизированного в ББМ
Выводы главы
ГЛАВА 5. Исследование комплекса ^р8М1/^рН1:г11 реконструированного в фосфолипидные нанодиски
5.1 Кристаллы реконструированного в нанодиски ^р8М1/^рН1:г11
5.2 Малоугловые измерения ^р8М1/^рН1:г11 реконструированного в нанодиски
5.3 Криоэлектронная микроскопия одиночных частиц для комплекса ^р8МЩрН1:г11 реконструированного в нанодиски
Выводы главы
БЛАГОДАРНОСТИ
БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ