Исследование геномов внутриядерных симбиотических бактерий рода Holospora методом пульс - электрофореза Тимофеева, Анна Сергеевна

Краткое описание

Тимофеева,АннаСергеевна.ИсследованиегеномоввнутриядерныхсимбиотическихбактерийродаHolosporaметодомпульс-электрофореза: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.07. - Санкт-Петербург, 1999. - 156 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61- 00 I/ На правах рукописи Санкт-Петербургский государственный университетТимофееваАннаСергеевнаИсследованиегеномоввнутриядерныхсимбиотическихбактерийродаНо1о8рогаметодомпульс-электрофореза, 03.00.07 - микробиология Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук Научный

стр. 8
исследовать и сравнивать организациюгеномову «куста» близкородственныхсимбиотическихбактерий. Данная работа является первым этапом в изучении организациигеномовHolospora. Продолжениеисследованиягеномовисследуемых намибактерий, возможно, позволит ответить на вопросы, касающиеся совместной коэволюции

стр. 9
последующие вьщеление и очистку симбионтов. В связи с этим, мы определили следующие конкретные задачи нашей работы: • Разработатьметодывыделения и препаративной очисткивнутриядерныхсимбиотическихбактерийи получить необходимое для проведения молекулярно-биологическихисследованийколичество симбионтов. • Адаптироватьметодпульс-электрофорезакисследованиюгеномоввнутриядерныхсимбионтов инфузорий. 10...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Тимофеева, Анна Сергеевна
Введение.
Глава 1. Обзор литературы.
1.1. Размер бактериальных геномов.
1.2. Линейные хромосомы бактерий.
1.3. Сложно организованные геномы бактерий.
1.4. Buchnera - внутриклеточные симбионты тлей.
1.5. Геномы внутриклеточных симбионтов инфузорий.
1.6. Симбиотическая система: Paramecium - Holospora.
Глава 2. Материалы и методы.
2.1. Использованные культуры.
2.2. Культивирование инфузорий.
2.3. Выделение и очистка симбионтов.
2.4. Заражение неинфицированных клонов Paramecium симбиотическими бактериями.
2.5. Приготовление агарозных блоков, содержащих ДНК Holospora.
2.6. Приготовление агарозных блоков, содержащих дрожжевую
2.7. Приготовление агарозных блоков, содержащих конкатемеры ДНК фага лямбда.
2.8. Обработка агарозных блоков, содержащих ДНК Holospora крупнощепящими рестриктазами.
2.9. Проведение пульс-электрофореза.
2.10. Перенос ДНК НоЬврога из агарозных гелей на найлоновую мембрану - «блоттинг».
2.11. Гибридизация на фильтрах (блот-гибридизация).
2.12. Определение количества и месторасположения нуклеоидов в клетке Но1озрога.
2.13. Компьютерная обработка полученные результатов.
Глава 3. Результаты.
3.1. Получение высокоочищенных фракций НоЬэрога.
3.1.1. Выделение и очистка Н.асигшг^а и Н.ситшси1а.
3.2. Исследование геномов НоЬэрога методом пульс-электрофореза.
3.2.1. Н.аситиМа.
3.2.2. Н.ситшси1а.
3.2.3. Н.ипёиЫа, Н.ге^а.
3.2.4. Н.оЫша.
3.3. Количество и расположение нуклеоидов в клетке Но1озрога.
Глава 4. Обсуждение.
4.1. Линейная структура репликона Но1озрога.
4.2. Физические карты геномов НоЬэрога.
4.2.1. Физические карты генома исследованных изолятов Н.асшшпа1а, специфичных к первому сингену Р.ЬигБапа.
4.2.2. Физические карты генома исследованных изолятов Н.асипшийа, специфичных ко второму сингену Р.Ьигзапа.
4.2.3. Физическая карта генома Н.ипс1и1а1а (изолят 94АБ4-18).