Исследование круга хозяев, полиморфизма и клонирование генома Х вируса шалота Калошин, Алексей Алексеевич

Краткое описание

Калошин,АлексейАлексеевич.Исследованиекругахозяев,полиморфизмаиклонированиегеномаХвирусашалота: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 1999. - 77 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
6 7 / У^-^6/^^о-а ВНИИ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОЙ БИОТЕХНОЛОГИИ РАСН Н а правах рукописи К А Л О Ш И НАлексейАлексеевичИССЛЕДОВАНИЕКРУГАХОЗЯЕВ,ПОЛИМОРФИЗМАИКЛОНИРОВАНИЕГЕНОМАXВИРУСАШАЛОТА. 03.00.03.-молекулярная биология ДИССЕРТАЦИЯ н а соискание у ч е н о й степени к а н д и д а т а б и о л о

стр. 4
ВРПГ ВСМЯ ВТМ лвг лвч лвш мвк нвпк онм ОРС ПЦР ПЭГ хвк антисыворотка А-, В-, С-, О-вирусычеснока 8 -вирускартофеля 8вирусхелениумавирусаспермии томатавирусжелтой карликовости лукавирусжелтой крапчатости рисавирусжелтой мозаики клеверавирусжелтой штриховатости лука-пореявирускольцевой пятнистости

стр. 4
некротической мозаики красного клеверавирусопаленности голубикивируспогремковости томатавирусраннего побурения горохавирусштриховатой мозаики ячменявирустабачной мозаики латентныйвирусгвоздики латентныйвирусчеснока латентныйвирусшалотаМвирускартофеля нитевидныйвируспереносимый клещом олигонуклеотид

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Калошин, Алексей Алексеевич
ВВЕДЕНИЕ
I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. Общая характеристика вирусов, поражающих культурные виды рода Allium
1.1. Потивирусы
1.1.1. Вирус желтой карликовости лука
1.1.2. Вирус желтой штриховатости лука-порея
1.1.3. Предполагаемые члены группы потивирусов
1.1.4. Нуклеотидные последовательности РНК потивирусов, выделенных из растений рода Allium
1.2. Карлавирусы
1.2.1. Латентный вирус шалота
1.2.2. Латентный вирус чеснока
1.3. Вирусы других групп, обнаруженные в растениях рода Allium
2. X вирус шалота и ХВШ-подобные вирусы
2.1. Морфология и физико-химические свойства вирусных частиц
2.2. Симптоматика и круг хозяев
2.3. Серологические свойства
2.4. Цитопатология
2.5. Характеристика геномной РНК
3. Организация генома и сравнительная характеристика генов карла-, потеке- и ХВШ-подобных вирусов
4. Инфекционные кДНК копии геномных РНК фитовирусов
4.1 .Конструкция и экспрессия инфекционных вирусных кДНК
4.2. Определение инфекционности к ДНК копий
4.3. Исследование полноразмерных кДНК копий геномных РНК вирусов
И. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
1. Выделение ХВШ и вирусной РНК
2. Синтез и клонирование кДНК
3. Получение однонаправленных делеций
4. Определение нуклеотидной последовательности
5. Отбор полноразмерных кДНК копий геномной РНК ХВШ
6. Получение протопластов
7. In vitro транскрипция
8. In vitro трансфекция протопластов
9. Электрофорез в сочетании с ИФА (Western blot)
10. Электронная микроскопия
11. Иммуносорбентная электронная микроскопия
12. Компьютерный анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей и вторичной структуры РНК
III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ.
1. Род Allexviruses: поиск новых видов и предложения по классификации и номенклатуре
2. Моновирусная инфекция растений X вируса шалота: герерогенность нуклеотидной последовательности геномной РНК и морфологическая гетерогенность вирионов
2.1. Морфологическая гетерогенность вирионов
2.2. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей
2.2.1. 42К белок
2.2.2. 28К белок
2.2.3. 15К белок
3. Полноразмерная кДНК-копия геномной РНК X вируса шалота: получение, клонирование, структура, in vitro транскрипция и тестирование инфекционности
3.1. Клонирование полноразмерной кДНК-копии ХВШ
3.2. Определение инфекционности кДНК-копий ХВШ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.
Ас антисыворотка
А-, В-, С-, О- ВЧ А-, В-, С-, О-вирусы чеснока
БВК Б - вирус картофеля
БВХ Б вирус хелениума
ВАТ вирус аспермии томата
ВЖКЛ вирус желтой карликовости лука
ВЖКР вирус желтой крапчатости риса
ВЖМК вирус желтой мозаики клевера
ВЖШЛП вирус желтой штриховатости лука-порея
ВКПЦ вирус кольцевой пятнистости цимбидиума
вмк вирус мозаики костра
ВМЦК вирус мозаики цветной капусты
вмч вирус мозаики чеснока
вмчпк вирус мозаики чеснока переносимый клещом
внмкк вирус некротической мозаики красного клевера
вог вирус опаленности голубики
впт вирус погремковости томата
ВРПГ вирус раннего побурения гороха
ВСМЯ вирус штриховатой мозаики ячменя
втм вирус табачной мозаики
лвг латентный вирус гвоздики
лвч латентный вирус чеснока
лвш латентный вирус шалота
мвк М вирус картофеля
нвпк нитевидный вирус переносимый клещом
онм олигонуклеотид - направленный мутагенез
ОРС открытая рамка считывания
ПЦР полимеразная цепная реакция
ПЭГ полиэтилен гликоль
хвк X вирус картофеля
ХВЧ X вирус чеснока
ХВШ X вирус шалота