Исследование регуляторных элементов ретротранспозона copia и влияния его инсерций на приспособленность Drosophila melanogaster Морозова, Татьяна Викторовна

Краткое описание

Морозова,ТатьянаВикторовна.ИсследованиерегуляторныхэлементовретротранспозонаcopiaивлиянияегоинсерцийнаприспособленностьDrosophilamelanogaster: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.15. - [Б. м.], [19--?]. - 137 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:04-3/593 ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ РАН ЛАБОРАТОРИЯ ГЕНОМНОЙ ИЗМЕНЧИВОСТИ ОТДЕЛ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ КЛЕТКИМОРОЗОВАТАТЬЯНАВИКТОРОВНАИССЛЕДОВАНИЕРЕГУЛЯТОРНЫХЭЛЕМЕНТОВРЕТРОТРАНСПОЗОНАcopiaИВЛИЯНИЯЕГОИНСЕРЦИИНАПРИСПОСОБЛЕННОСТЬDROSOPHILAMELANOGASTER03.00.15 - генетика Диссертация

стр. 6
примереретротранспозонаcopia. Для этого предполагалось, во-первых, исследовать рольрегуляторныхрайоновcopiaв контроле экспрессииретротранспозонаи, во-вторых, оценить селективную значимостьегоинсерциив геномеDrosophilamelanogaster. Выборcopiaв качестве модельного МЭ дляисследованияобусловлен

стр. 119
эмбриональной стадии и в генеративных органах самок и самцов на стадии личинки и имаго и полностью блокирует экспрессию в соматических тканях. 119 ИзучениевлиянияинсерцийретротранспозоновнаприспособленностьособейDrosophilamelanogasterпоказало, что: 5. Накоплениеретротранспозоновcopiaи Doc в геноме приводит к снижениюприспособленностиособей, что свидетельствует о преимущественно негативномвлиянииинсерций...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Морозова, Татьяна Викторовна
ВВЕДЕНИЕ.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1. Ретротранспозон copia Drosophila melanogaster.
1.1 Особенности строения и транскрипции.
1.2 Механизм транспозиции ретротранспозона copia.
2. Молекулярные механизмы регуляции активности copia.
2.1 Исследование регуляторных последовательностей МЭ с помощью трансгенных конструкций.
2.1.1 Однокомпонентные вектора на основе Р-элемента.
2.1.2 Система векторов GAL4/UAS.
2.1.3 Система векторов FLP/FRT.
2.1.4 Тетрациклин-зависимая система.
2.1.5 Система векторов Cre/loxP и FLP/FRT.
2.1.6 Репортерные гены, используемые в векторах при изучении D. melanogaster.
2.2 Регуляторные области ретротранспозона copia.
2.3 Геномные факторы, взаимодействующие с регуляторными элементами copia.
3. Влияние МЭ на приспособленность.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
4.1 Основные растворы.
4.2 Лабораторные линии, использованные в работе.
4.3 Определение индекса конкуренции.
4.4 Определение выживаемости яиц.
4.5 Р-зависимая трансформация эмбрионов.
4.5.1 Оборудование для инъекций.
4.5.2 Получение и анализ трансформантов.
4.5.3 Сбор эмбрионов после инъекций.
4.6 Репортерные конструкции, использованные в работе.
4.7 Гистохимическая окраска органов на активность р-галактозидазы.
4.8 Количественное определение активности /?-галактозидазы.
4.9 Молекулярно-биологические методы.
4.9.1 Выделение геномной ДНК D. melanogaster.
4.9.2 Выделение плазмидной ДНК.
4.9.3 Ферментативная обработка ДНК.
4.9.4 Гель-электрофорез фрагментов ДНК.
4.9.5 Трансформация бактериальных клеток.
4.9.6 Саузерн-блот гибридизация.
4.9.6.1 Перенос ДНК из агарозных гелей на нейлоновый фильтр Hybond N
4.9.6.2 Мечение ДНК методом рассеянной затравки.
4.9.6.3 Гибридизация с меченым зондом.
4.10 Определение сайтов локализации МЭ на хромосомах.
4.10.1 Приготовление давленых препаратов политенных хромосом слюнных желез D. melanogaster.
4.10.2 Приготовление ДНК зондов, меченых биотином.
4.10.3 Проведение гибридизации in situ.
4.11 Оценка числа копий и частоты транспозиций МЭ в геноме.
4.11.1 Оценка гаплоидного числа копий.
4.11.2 Измерение частоты транспозиций МЭ.
4.12 Обработка результатов.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
5.1 Регуляторные последовательности ретротранспозона copia.
5.2 Влияние числа копий ретротранспозона copia на приспособленность. 101 5.2.1 Изменение частоты транспозиций, числа копий copia и приспособленности особей в инбредных сублиниях линии 2Ь.
5.2.1.1 Изменение числа копий copia.
5.2.1.2 Изменение паттерна сайтов локализации copia.
5.2.1.3 Изменение приспособленности в условиях инбридинга и ослабленной селекции в линиях с различной частотой транспозиций copia.
5.2.3 Число копий ретротранспозонов и приспособленность в линиях 2Ь
ВЫВОДЫ.