Исследование структурно-функциональных аспектов взаимодействия р50 субъединицы NF-кВ с ДНК-дуплексами в растворе Тимченко, Мария Александровна

Краткое описание

Тимченко,МарияАлександровна.Исследованиеструктурно-функциональныхаспектоввзаимодействияр50субъединицыNF-кВсДНК-дуплексамиврастворе: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 2005. - 129 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
ФАКУЛЬТЕТ На правах рукописи '» УДК 577.113.4ТИМЧЕНКОМарияАлександровнаИССЛЕДОВАНИЕСТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫХАСПЕКТОВВЗАИМОДЕЙСТВИЯр50СУБЪЕДИНИЦЫNF-KB С ДНКДУПЛЕКСАМИ ВРАСТВОРЕ03.00.03 - молекулярная биология Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук Научный руководитель:

стр. 2
механизма связывания белка р50 сДНКврастворе39 4 Стр. И.ИССЛЕДОВАНИЕСТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫХАСПЕКТОВВЗАИМОДЕЙСТВИЯр50СУБЪЕДИНИЦЫNF-KB СДНК-ДУПЛЕКСАМИВРАСТВОРЕ47 49 49 57 59 (Обсулсдение результатов) И.1. Сравнение физико-химических характеристик рекомбинантных белков p50-GST и p50-His6 •.

стр. 72
в своем составе меньший довесок. 73 II.2.СТРУКТУРНЫЕАСПЕКТЫВЗАИМОДЕЙСТВИЯБЕЛКА р50 NF-KB СДНК-ДУПЛЕКСАМИВРАСТВОРЕП.2.1. СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА БЕЛКА р50 С ДНК ВРАСТВОРЕДляисследованияизменений в конформации при комплексообразовании белка p50-His6 с ДНК использовался метод малоуглового рентгеновского

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Тимченко, Мария Александровна
УСЛОВНЫЕ СОКРАЩЕНИЯ
ВВЕДЕНИЕ 7 I. РОЛЬ NF-кВ В КЛЕТОЧНЫХ ПРОЦЕССАХ И ОСОБЕННОСТИ
СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ БЕЛКА {Литературный обзор)
1.1. Роль NF-кВ в клеточных процессах
1.1.1. Семейство NF-kB
1.1.2. Роль NF-кВ в иммунном ответе организма и онкогенезе
1.1.3. Сигнальные пути активации NF-kB
1.1.4. Регуляция транскрипционной и ДНК-связывающей активности белка
1.1.4.1. Регуляция активности NF-кВ с помощью фосфорилирования сериновых остатков белка
1.1.4.2. Окислительно-восстановительная регуляция активности NF-кВ в клетке
1.1.5. Специфичность узнавания NF-kB
1.2. Особенности структурной организации NF-кВ и его комплексов с ДНК
1.2.1. Структура р50 субъединицы NF-kB
1.2.2. Структура комплекса р50 субъединицы NF-кВ с ДНК
1.2.2.1. Кристаллическая структура комплекса р50 субъединицы NF-кВ с ДНК
1.2.2.2. Исследование конформационных особенностей комплекса р50 субъединицы NF-кВ с ДНК и механизма связывания белка pSO с ДНК в растворе
II. ИССЛЕДОВАНИЕ СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ АСПЕКТОВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ р50 СУБЪЕДИНИЦЫ NF-кВ С ДНК-ДУПЛЕКСАМИ В РАСТВОРЕ
Обсуждение результатов)
11.1. Сравнение физико-химических характеристик рекомбинантных белков
§0-GST и p50-His6 49 Н.1.1. Исследование конформации белков p50-GST и p50-His6 в растворе
11.1.2. Анализ структуры белков p50-GST и p50-His методом кругового дихроизма
11.1.3. Изучение влияния пептидных довесков на ДНК-связывающий центр белков pSO-GST и p50-His
11.2. Структурные аспекты взаимодействия белка р50 NF-kB с ДНК-дуплексами в растворе
11.2.1. Структура комплекса белка р50 с ДНК в растворе
11.2.2. Структура ДНК-связывающего центра белка р50 NF-kB 76 Н.2.2.1. Изучение влияния замены аминокислотных остатков Cys62, Lysl47 и Lys278 на Ala в белке р50 NF-kB на его структуру
11.2.2.2. Изучение влияния замены аминокислотных остатков Cys62, Lysl47 и Lys278 на Ala в белке р50 NF-kB на его комплексообразование с ДНК
11.2.2.3. Изучение влияния замены аминокислотных остатков Cys62, Lysl47 и Lys278 на Ala в белке р50 NF-kB на ДНК-связывающий центр белка
11.3. ПУТИ ИНГИБИРОВАНИЯ ФАКТОРА ТРАНСКРИПЦИИ NF-kB В ОПУХОЛЕВЫХ КЛЕТКАХ
11.3.1. Модифицированные ДНК-дуплексы как потенциальные регуляторы активности NF-кВ в клетке
Н.3.2. Ингибирование NF-кВ с помощью антиракового препарата кобальт-фталоцианинового комплекса
III. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
ВЫВОДЫ