Изучение конъюгативной способности крупных плазмид из почвенных штаммов Bacillus subtilis Федорина, Екатерина Александровна

Краткое описание

Федорина,ЕкатеринаАлександровна.ИзучениеконъюгативнойспособностикрупныхплазмидизпочвенныхштаммовBacillussubtilis: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.15. - Москва, 2006. - 122 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:06-3/906 РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ ОБЩЕЙ ГЕНЕТИКИ имени Н.И.ВАВИЛОВА На иравах рукописиФЕДОРИНАЕКАТЕРИНААЛЕКСАНДРОВНАИзучениеконъюгативнойспособностикрунных нлазмид изпочвенныхштаммовBacillussubtilis03.00.15-Генетика Диссертация иа соискание ученой стенени кандидата биологических

стр. 3
3.2.1.1.3. 3.2.1.1.4. 3.2.1.1.5. 3.2.1.2. 3.2.1.2.1. 3.2.1.2.2. 3.2.2. 3.2.2.1. 3.2.2.2. 3.2.2.3. 3.2.2.4. 3.2.2.5. 3.2.3. Поисккрупныхнлазмид вштаммахB.subtilisСравнение обнаруженныхкрупныхплазмидс минирепликоиом нлазмнды р19 из белорусской коллекции B.subtilisОпределениеспособностикруннойплазмидыизштаммаB.subtilis1440 к мобилизационному переносуИзучениекопъюгативныхспособностейкрунной...

стр. 7
природныхштаммовBacillussubtilis. В задачи исследования входило: 1. Поиск круппыхплазмидв природныхштаммахB.subtilis. 2.Изучениеособенностейконъюгативноймобилизации мелких неконъюгативныхплазмид, определяемой круппойплазмидойиз природпогоштаммаB.subtilis3. Маркированиекрупнойконъюгативной

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Федорина, Екатерина Александровна
СОДЕРЖАНИЕ.
Список сокращений.
ВВЕДЕНИЕ.
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1.1. Плазмиды Bacillus subtilis и других видов бацилл.
1.1.1. Общая характеристика бациллярных плазмид.
1.1.2. Свойства, определяемые генами мелких плазмид бацилл.
1.1.3. Свойства, определяемые генами крупных плазмид бацилл.
1.1.4. Репликация плазмид.
1.1.4.1 Репликация по механизму катящегося кольца.
1.1.4.2. Тета-тип репликации.
1.2. Бактериальная конъюгация.
1.2.1. Механизмы конъюгационных процессов у грамотрицательных микроорганизмов на примере F-фактора E.coli.
1.2.2. Конъюгация у грамположительных микроорганизмов.
1.2.2.1. Механизмы конъюгации у грамположительных бактерий.
1.2.2.1.1. Структуры, вовлекаемые в процесс конъюгации.
1.2.2.1.2. Сходство элементов конъюгативного аппарата с компонентами системы секреции IV типа.
1.2.2.2. Конъюгативная мобилизация RCR плазмид.
1.2.2.3. Коныогативные транспозоны.
1.2.2.4. Конъюгация у бацилл.
1.2.2.4.1. Группа В.сеreus.
1.2.2.4.2. Группа В. subtilis.
1.2.2.5. Конъюгация у других грамположительных микроорганизмов.
1.2.2.5.1. Конъюгативный перенос с участием плазмид широкого круга хозяев. Конъюгация у стафилококков, лактококков и других грамположительных микроорганизмов.
1.2.2.5.2. Феромонзависимая конъюгация у энтерококков.
1.2.2.5.3. Конъюгация у стрептомицетов.
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
3. РЕЗУЛЬТАТЫ.
3.1. Поиск и характеристика крупных природных плазмид в штаммах Bacillus subtilis, выделенных из почв Москвы и Московской области.
3.1.1. Поиск крупных плазмид в штаммах В.subtilis.
3.1.2. Сравнение обнаруженных крупных плазмид с минирепликоиом плазмиды р19 из белорусской коллекции B.subtilis.
3.1.3. Определение способности крупной плазмиды из штамма B.subtilis 1440 к мобилизационному переносу.
3.2. Изучение конъюгативных способностей крупной плазмиды из почвенного штамма B.subtilis 19.
3.2.1. Мобилизация мелких неконъюгативных плазмид.
3.2.1.1. Изучение особенностей мобилизации pUBllO.
3.2.1.1.1. Определяющая роль р19 в мобилизации pUBllO.6S
3.2.1.1.2. Изучение влияния протеиназы К на мобилизацию pUBllO.
3.2.1.1.3. Кинетика переноса pUBllO при разных температурах.
3.2.1.1.4. Мобилизационный перенос pUBllO при использовании различных штаммов B.subtilis.
3.2.1.1.5. Перенос pUBllO в штаммы разных видов Bacillus.
3.2.1.2. Мобилизация других неконъюгативных плазмид.
3.2.1.2.1. Изучение переноса плазмид с сигма-типом репликации (рВС16, рС194).
3.2.1.2.2. Изучение переноса плазмиды, имеющей тета-репликон.
3.2.2. Изучение конъюгативного переноса собственно крупной плазмиды р19.
3.2.2.1. Маркирование крупной криптической плазмиды р19.
3.2.2.2. Частота конъюгативного переноса плазмиды pl9cat.
3.2.2.3. Конъюгативный перенос pl9cat при разных соотношениях донора и реципиента.
3.2.2.4. Кинетика конъюгативного переноса pl9cat.
3.2.2.5. Особенности переноса р19 при использовании в качестве партнеров при конъюгации различных штаммов B.subtilis.
3.2.3. Анализ мутантов р19 с нарушенной способностью к конъюгации
3.2.3.1. Клонирование в клетках E.coli фрагментов р19, обуславливающих способность плазмиды к конъюгациоиному переносу.
3.2.3.2. Идентификация фрагмента ДНК, соответствующего рЗ-102, в клонотеке фрагментов ДНК р19.
3.2.3.3. Определение нуклеотидной последовательности фрагмента ДНК р19 и се анализ.
4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
ВЫВОДЫ