Изучение особенностей первичной структуры генома вакцинного штамма вируса табачной мозаики V-69 Снегирева, Полина Борисовна

Краткое описание

Снегирева,ПолинаБорисовна.ИзучениеособенностейпервичнойструктурыгеномавакцинногоштаммавирусатабачноймозаикиV-69: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.15. - Москва, 1999. - 134 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ ОБШЕЙ ГЕНЕТИКИ им. Н.И.ВАВИЛОВА на правах рукописи УДК 577.113.5:578.865.1СНЕГИРЕВАПолинаБорисовнаИЗУЧЕНИЕОСОБЕННОСТЕЙПЕРВИЧНОЙСТРУКТУРЫГЕНОМАВАКЦИННОГОШТАММАВИРУСАТАБАЧНОЙМОЗАИКИУ-69 Диссертация на соискание 5Д1еной степени кандидата биологических наук

стр. 7
вирускольцевой пятнистости орхидеи; 6)вирусслабой крапчатости паприки; 7)вирусслабой крапчатости перца; 8)вирусмозаикиподорожника; 9)вирусмозаикикроталярии; 10)вирусслабой зеленоймозаикитабака; 11)вирустабачноймозаики; 12) тобамовирус ОЬ; 13)вирусмозаикитоматов; 14)вируспосветления

стр. 9
ш 209 Рис.1. Организациягеномовтобамовирусов:ВТМ -вирустабачноймозаики, ВСЗМТ -вирусслабой зеленоймозаикитабака, В С Ю ! -вирусслабой крапчатости перца, ОЬ - тобамовирус ОЬ, ВЗКМО -вирусзеленой крапчатоймозаикиогурца, ВМКвирусмозаикикроталярии. Кодирующие областигеномовпредставлены

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Снегирева, Полина Борисовна
СОДЕРЖАНИЕ
Стр.
1. ВВЕДЕНИЕ
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
2.1. Организация генома ВТМ
2.1.1. Геном ВТМ содержит три открытые рамки считывания
2.1.2. Структура концевых некодирующих участков генома
2.1.3. Субгеномные мРНК
2.1.4. Сборка вирусных частиц
2.2. Репликация и синтез вирусных белков
2.3. Ближний транспорт ВТМ
2.3.1. Плазмодесмы в системе межклеточного транспорта растения
2.3.2. Вирусы растений кодируют специальные транспортные белки
2.3.3. Транспортный белок ВТМ
2.3.4. Механизм межклеточного транспорта ВТМ
2.4. Дальний транспорт ВТМ
2.5. Перекрестная защита растений
2.5.1. Феномен перекрестной защиты и успехи ее практического использования
2.5.2. Механизм перекрестной защиты
2.5.3. Молекулярные основы аттенуации вакцинных штаммов
3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
3.1. Материалы
3.1.1. Растительный материал
3.1.2. Бактериальные штаммы
3.1.3. Плазмидные векторы
3.1.4. Олигонуклеотидные праймеры
3.1.5. Ферментные препараты
3.1.6. Реактивы и расходные материалы
3.1.7. Среды
3.1.8. Фотоматериалы
3.2. Методы
3.2.1. Получение препарата РНК ВТМ У-69
3.2.1.1. Получение и осветление экстракта
3.2.1.2. Дробное высаливание вирусных частиц
3.2.1.3. Дальнейшая очистка препарата вирусных частиц
3.2.1.4. Выделение геномной РНК BTM V-69
3.2.2. Синтез кДНК генома BTM V-69
3.2.2.1. Получение набора случайных фрагментов кДНК генома BTM V-69
3.2.2.2. Направленный синтез перекрывающихся фрагментов кДНК
с пар специфических праймеров
3.2.3. Встраивание кДНК в вектор
3.2.4. Трансформация бактериальных клеток рекомбинантными плазмидами
3.2.5. Выделение плазмидной ДНК
3.2.6. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
3.2.7. Реакции секвенирования
3.2.7.1. Секвенирование по Максаму и Гилберту
3.2.7.2. Секвенирование по Сэнгеру
3.2.8. Электрофоретическое разделение продуктов реакций секвенирования
в полиакриламидном геле (ПААГ)
3.2.8.1. Приготовление секвенирующего геля
3.2.8.2. Проведение электрофореза
3.2.8.3. Обработка геля после электрофореза
4. РЕЗУЛЬТАТЫ
4.1. Клонирование генома BTM V-69
4.1.1. Клонотека случайных фрагментов кДНК генома BTM V-69
4.1.2. Клонотека перекрывающихся фрагментов кДНК генома BTM V-69
4.2. Нуклеотидная последовательность геномной РНК вакцинного штамма V-69 вируса табачной мозаики
5. ОБСУЖДЕНИЕ
6. ВЫВОДЫ
7. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ