Клонирование и изучение S-REX - нового гена со специфической компартментализацией mРНК в нейронах Бака, Иван Дмитриевич

Краткое описание

Бака,ИванДмитриевич.КлонированиеиизучениеS-REX-новогогенасоспецифическойкомпартментализациейmРНКвнейронах: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 1999. - 114 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ им. В.А. Энгельгардта На правах рукописи У Д К 575:595БакаИванДмитриевичКЛОНИРОВАНИЕИИЗУЧЕНИЕS-MeXНОВОГОГЕНАСОСПЕЦИФИЧЕСКОЙКОМПАРТМЕНТАЛИЗАЦИЕЙмРНК ВНЕЙРОНАХСпециальность 03.00.03 - молекулярная биология Диссертация на соискание ученой

стр. 33
н и я н и и химерных Р Н К , могли бы дать существенную природы этих взаимодействий. 34 1.3 Применение метода субтрактивной гибридизации дляклонированияиизучениягенов,специфическиэкспрессирующихся в определенных типах клеток и органов. Для к л о н и р о в а н и я т к а н е с п е ц и ф и ч е с

стр. 73
срезами 10-12-дневных э м б р и о н о в м ы ш и (Е10Е12) мРНК продемонстрировала (Рис.19). В дифференциальную мозгу экспрессию S-ReXsи (Ell) S-Rexb S-Rex^ спинном 11-дневных э м б р и о н о в экспрессируется в постмитотическихнейронах, а S-Rex^, - исключительно в базальной пластинке. В 12-дневных эмбрионах

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Бака, Иван Дмитриевич
ОГЛАВЛЕНИЕ
Стр.
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Дифференцированное распределение мРНК в ооцитах, развивающихся эмбрионах и некоторых типах соматических клеток
1.1.1. Возможные причины асимметричного распределения мРНК в клетках
1.1.2. Сигнальные последовательности, детерминирующие неслучайное распределением РНК в цитоплазме клеток
1.1.3. Возможные механизмы, посредством которых сигнальные последовательности нацеливают мРНК к местам их локализации
1.2. Особенности дифференцированного распределения мРНК в нейронах
1.2.1. Тип ы мРНК и их распределение в нейронах
1.2.2. Методические подходы для выявления мРНК, локализованных в дендритах
1.2.3. Возможные механизмы, обуславливающие направленную локализацию мРНК в нейронах и экспериментальные
подходы для их установления
1.3. Применение метода субтрактивной гибридизации для клонирования и изучения генов, специфически экспрессирующихся в определенных типах клеток и органов
1.4. Заключение 38 Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Реактивы и материалы
2.2. Биологические материалы
2.3. Выделение плазмидной ДНК
2.4. "Спасение" рекомбинантной плазмиды in vitro из бактериофага
A ZAPI1
2.5. Элюция фрагментов ДНК из агарозного геля с низкой температурой плавления
2.6. Радиоактивное мечение ДНК-зонда методом ник-трансляции
2.7. Радиоактивное мечение ДНК-зонда с использованием случайной затравки
2.8. Выделение суммарной РНК
2.9. Выделение поли(А)+ РНК
2.10. Хроматография на колонке Qiagen tip 5
2.11. Фракционирование РНК в агарозном геле, содержащем формальдегид
2.12. Перенос РНК на Hybond N
2.13. Гибридизация РНК-содержащих фильтров
2.14. Синтез DIG кРНК для in situ гибридизации
2.15. Синтез одноцепочечной кДНК
2.16. Биотинилирование поли(А)+ РНК
2.17. Субтрактивное клонирование кДНК из ограниченного
количества биологического материала
2.18. in situ гибридизация с DIG кРНК
2.19. Секвенирование ДНК
2.20. Полимеразная цепная реакция
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
ЗЛ. Модифицированный метод конструирования субтрактивной кДНК библиотеки и его применение для выделения синаптомсомспецифических клонов
3.2. S-Rex - новый нейроспецифический ген
3.3. Получение полных кДНК копий для двух основных транскриптов S-Rex гена крысы и цыпленка
3.4. Нетранслируемые области S-Rex
3.5. NSP - аналог S-Rex в геноме человека
3.6. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей
S-Rex белков
3.7. Внутриклеточная локализация S-Rex транскриптов
3.8. Экспрессия S-Rex мРНК в эмбриональном и постнатальном развитии
3.9.Другие транскрипты, являющиеся продуктами альтернативного сплайсинга внутренних экзонов S-Rex гена
ВЫВОДЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ