Механизм подавления опухолевой прогрессии под действием ДНКазы I Алексеева Людмила Александровна

Краткое описание

Алексеева,ЛюдмилаАлександровна.МеханизмподавленияопухолевойпрогрессииподдействиемДНКазыI: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.04 /АлексееваЛюдмилаАлександровна; [Место защиты: Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук]. - Новосибирск, 2020. - 158 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
медицины На правах рукописиАлексееваЛюдмилаАлександровнаМеханизмподавленияопухолевойпрогрессииподдействиемДНКазыI 03.01.04 Биохимия Диссертация

стр. 4
анализ...............................................................................................................................72 ГЛАВА 3.МЕХАНИЗМПОДАВЛЕНИЯОПУХОЛЕВОЙПРОГРЕССИИПОДДЕЙСТВИЕМДНКАЗЫI .................................................................................................................73 3.1. Изменение параметровопухолевыхкультурподдействиембычьей панкреатическойДНКазыI in...

стр. 72
≤ 0.05 отражало статистически достоверные отличия. Для статистического анализа использовали программу STATISTICA 10.0. 73 ГЛАВА 3.МеханизмподавленияопухолевойпрогрессииподдействиемДНКазыI 3.1. Изменение параметровопухолевыхкультурподдействиембычьей панкреатическойДНКазыI in vitro 3.1.1.

Оглавление диссертациикандидат наук Алексеева Людмила Александровна
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ВНЕКЛЕТОЧНЫЕ ДНК КАК СПЕЦИФИЧЕСКИЙ ОПУХОЛЕВЫЙ АГЕНТ: ХАРАКТЕРИСТИКА И ФУНКЦИИ
1.1. Введение
1.2. Характеристика циркулирующих внДНК крови
1.3. Концентрация внДНК
1.4. Состав внДНК
1.4.1. GC-состав внДНК
1.4.2. Последовательности онкогенов и онкосупрессоров среди внДНК
1.4.3. Хромосомные перестройки, обнаруживаемые во фрагментах внДНК
1.4.4.Тандемные и сателлитные повторы
1.4.5. Мобильные генетические элементы в составе внДНК
1.4.6. Вирусная и митохондриальная ДНК в составе внДНК
1.4.7. Статус метилирования внДНК
1.5. Биогенез внДНК
1.5.1. Источники внДНК
1.5.2. Апоптоз как источник внДНК
1.5.3. Некроз как источник внДНК
1.5.4. Секреция как источник внДНК
1.5.5. Нетоз и образование NET
1.5.6. Распознавание ДНК
1.6. Патогенез внДНК в крови онкологических больных
1.6.1. Участие внДНК опухолевого происхождения в злокачественной трансформации здоровых клеток
1.6.2. Взаимоотношения NET и опухолей
1.7. Применение ДНКазы I в качестве антиметастатического и противоопухолевого агента
Заключение
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Материалы
2.1.1 Реактивы и препараты
2.1.2 Оборудование
2.1.3. Плазмиды
2.1.4. Буферы и растворы
2.1.5. Олигонуклеотиды
2.1.6. Клеточные культуры
2.1.7. Лабораторные животные и опухолевые модели
2.2. Методы
2.2.1. Электрофоретическое разделение нуклеиновых кислот
2.2.2. Приготовление первичной культуры опухолевых клеток LLC и RLS40
2.2.3 Опухолевые модели мыши
2.2.4. Получение сыворотки крови
2.2.5. Выделение ДНК
2.2.6. Исследование влияния бычьей панкреатической ДНКазы I и Пульмозима™ на опухолевые клетки
in vitro
2.2.7. Исследование противоопухолевого и антиметастатического потенциала бычьей панкреатической ДНКазы I и Пульмозима™
2.2.8. Приготовление ДНК-библиотек и секвенирование
65
2.2.9. Трансфекция клеток KB-3-1 человека внДНК, полученной из сыворотки крови мышей с LLC
2.2.10. Определение уровня SINE и LINE элементов с помощью qPCR
2.2.11. Статистический анализ
ГЛАВА 3. МЕХАНИЗМ ПОДАВЛЕНИЯ ОПУХОЛЕВОЙ ПРОГРЕССИИ ПОД ДЕЙСТВИЕМ ДНКАЗЫ I
3.1. Изменение параметров опухолевых культур под действием бычьей панкреатической ДНКазы I
in vitro
3.1.1. Линии опухолевых клеток, использованные в работе
3.1.2. Определение чувствительности клеток меланомы B16 к ДНКазе I
3.1.3. Влияние ДНКазы I на концентрацию внДНК на поверхности клеток LLC, B16 и RLS40 и в культуральной среде
3.1.4. Влияние ДНКазы I на миграционную активность опухолевых клеток B16
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
3.2. Исследование антиметастатического, противоопухолевого и иммуномодулирующего действия ДНКазы I in vivo
3.2.1. Опухолевые модели, использованные в работе
3.2.2. Исследование противоопухолевого и антиметастатического действия ДНКазы I при различных типах введения на модели LLC
3.2.3. Противоопухолевое и антиметастатическое действие ДНКазы I на моделях опухолей B16 и RLS40
3.2.4. Влияние дозы ДНКазы I на интенсивность противоопухолевого эффекта на моделях B16 мышей C57Bl и RLS40 мышей CBA
3.2.5. Влияние ДНКазы I на ДНКазную активность и концентрацию внДНК в сыворотке крови мышей с B16, LLC и RLS40
3.2.6. Влияние ДНКазы I на морфофункциональное состояние органов иммунной системы мышей с меланомой В16
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
3.3. Поиск молекулярных мишеней ДНКазы I среди внДНК сыворотки крови на модели карциномы легких Льюис
3.3.1 Дизайн эксперимента и приготовление ДНК-библиотек
3.3.3 Получение микрочастиц с иммобилизованными амлифицированными фрагментами ДНК-
библиотек с помощью эмульсионной ПЦР
3.3.3. Анализ данных секвенирования
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
3.4. Исследование роли SINE и LINE элементов как возможных маркеров опухолевой прогрессии и их связи с метастазированием
3.4.1. Анализ представленности повторов SINE и LINE элементов в крови мышей с различными типами опухолей
3.4.2. Исследование способности внДНК крови мышей с LLC проникать в клетки KB-3-1 человека
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
3.5. Исследование антиметастатического, противоопухолевого и иммуномодулирующего действия препарата Пульмозим™ in vitro и in vivo
3.5.1. Определение ДНКазной активности и цитотоксичности препарата Пульмозим™ in vitro
3.5.2. Влияние Пульмозима™ на миграционную активность опухолевых клеток B16
3.5.3. Антиметастатическое действие Пульмозима™ на модели меланомы B16
3.5.4. Действие Пульмозима™ на уровни SINE и LINE элементов в пуле внДНК
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ