Молекулярно-генетический анализ генов IT-15 и DMPK в популяциях и в семьях с миотонической дистрофией и хореей Гентингтона Малышева, Ольга Викторовна

Краткое описание

Малышева,ОльгаВикторовна.Молекулярно-генетическийанализгеновIT-15иDMPKвпопуляцияхивсемьяхсмиотоническойдистрофиейихореейГентингтона: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.15. - Санкт-Петербург, 2000. - 175 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ Кафедра генетики и селекции На правах рукописиМалышеваОльгаВикторовнаМОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИИАНАЛИЗГЕНОВIT-15 И D M P K ВПОПУЛЯЦИЯХИ ВСЕМЬЯХСМИОТОНИЧЕСКОЙДИСТРОФИЕЙИХОРЕЕЙГЕНТИНГТОНАСпециальность 05:00.15 - генетика Диссертация на соискание

стр. 3
иммунологическая детекция связавшейся метки 2.4.Методы статистическогоанализаГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ 3.1.ГенОМРК 3.1.1. Спектр аллелей СТО-повторовгенаВМРК в русскойпопуляции3.1.2.Анализаллелей СТО-повторовгенаОМРК у больныхдистрофией3.1.2.1. ПЦР-анализ75 76 77 77 77миотонической81 82 3.1.2.2.

стр. 4
гаплотипов 3.2. Ген1Т-15 аллелей С АО-повторовгенаIT-15 в четырех 101 104 различных 104 108 различных 113 115 в четырех 118 121 3.2.1. Спектрпопуляциях3.2.2.Анализаллелей ОАО-повторовгенаIT-15 у больных ХГ 3.2.3. Аллелипопуляциях3.2.4.Анализобласти, содержащей ОАО и ССО-повторы в целом. 3.2.5.Анализпопуляциях3.2.6. Аллели ССО-повторовгенаIT-15 у больных ХГ гаплотипов САО-ССО-повторов ССО-повторовгенаIT-15 в...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Малышева, Ольга Викторовна
Список сокращений.,.
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1.1. Экспансии микро- и минисателлитных повторов как причина наследственных болезней человека.
1.2. Общие черты болезней экспансии.
1.3. Типы заболеваний, ассоциированных с экспансиями тринуклеотидных повторов. Патогенез болезней экспансии.
1.3.1. Заболевания, сопровождающиеся образованием фрагильных сайтов.
1.3.2. Атаксия Фридрейха - экспансия САА-повторов в интронной части гена.
1.3.3. Нейро дегенеративные заболевания.
1.3.3.1. Хорея Гентингтона.Ген IT-15.
1.3.4. Миотоническая дистрофия - заболевание, ассоциированное с экспансией CTG-повторов в З'-нетранслируемой области гена. Ген DMPK.
1.4. Модели механизмов экспансии.
1.5. Факторы, влияющие на стабильность тринуклеотидных повторов в генах, ассоциированных с болезнями экспансии.
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1 Реактивы, ферменты, биопрепараты, оборудование.
2.2. Характеристика семей и популяций.
2.3. Методы исследования.
2.3.1. Выделение ДНК из лейкоцитов периферической крови.
2.3.2. Выделение ДНК из пятен крови.
2.3.3. Полимеразная цепнапя реакция(ПЦР).
2.3.4. Рестрикция ПЦР-фрагментов эндонуклеазами НтП и НЬа1.;.
2.3.5. Проведение электрофореза и визуализация результатов.
2.3.6. ПЦР-анализ количества С АО-повторов в гене 1Т-15.
2.3.7. Анализ числа тринуклеотидных повторов по результатам ПЦР.
2.3.8. Рестрикция геномной ДНК эндонуклеазой ЕсоШ.
2.3.9. Гель-электорфорез рестрицированной геномной ДНК.
2.3.10.Перенос фрагментов ДНК на нейлоновую мембрану.
2.3.11.Нерадиоактивное мечение плазмидной ДНК.
2.3.12.Проведение блот-гибридизации по Саузерну и иммунологическая детекция связавшейся метки.
2.4.Методы статистического анализа.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ.
3.1. Ген ОМРК.
3.1.1.Спектр аллелей СТО-повторов гена ОМРК в русской популяции.
3.1.2.Анализ аллелей СТО-повторов гена БМРК у больных миотонической дистрофией.
3.1.2.1. ПЦР-анализ.Г.
3.1.2.2. Прямое определение экспансий СТО-повторов гена БМРК у больных миотонической дистрофией и членов их семей.
3.1.2.3. МД в семье, не имеющей экспансии CTG-повторов в гене DMPK.
3.1.3.Анализ гаплотипов хромосом с различным числом CTG-повторов в гене DMPK.
3.1.3.1. Полиморфные сайты Hhal в интроне 5 и Hinfl в интроне 9 гена DMPK.
3.1.3.2.Аллели с инсерцией и делецией Alu-элемента и их связь с аллелями CTGповторов и вариантами гаплотипов.
3.2. Ген IT-15.
3.2.1. Спектр аллелей С AG-повторов гена IT-15 в четырех различных популяциях.
3.2.2. Анализ аллелей CAG-повторов гена IT-15 у больных ХГ.
3.2.3. Аллели CCG-повторов гена IT-15 в четырех различных популяциях.
3.2.4. Анализ области, содержащей CAG и CCG-повторы в целом.
3.2.5. Анализ гаплотипов CAG-CCG-повторов в четырех популяциях.
3.2.6. Аллели CCG-повторов гена IT-15 у больных ХГ.
3.2.7. Полиморфизм del2642 в четырех различных популяциях и у больных ХГ.
3.2.8. Некоторые проблемы молекулярной диагностики ХГ.
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ.