Молекулярный анализ полной копии ретротрансозона репейник Drosophila melanogaster Краснов, Алексей Николаевич

Краткое описание

Краснов,АлексейНиколаевич.МолекулярныйанализполнойкопииретротрансозонарепейникDrosophilamelanogaster: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 1999. - 79 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 3
Авторадиография. 3.6. Используемое программное обеспечение. 4. Результаты. 4.1. Геномный блотанализрепейника. 4.2. Клонирование разныхкопийрепейника. 4.3. Нуклеотидная последовательностьполнойкопиирепейника. 4.4. Открытые рамки считыванияполнойкопиирепейника. 4.5. Сравнительныйанализразличныхкопий

стр. 56
соответственно протеазу, обратную транскриптазу, РНКазуН и интегразу[92]. 4.5. Сравнительныйанализразличныхкопийрепейника. Для определения делегированных участков в неполныхкопияхрепейника, был проведен сравнительныйанализполнойкопиирепейникаburl4, ранее полученнойкопииburO и четырех неполных

стр. 67
intestinalis mdg3DrosophilamelanogastermicrocopiaDrosophilamelanogasterZAMDrosophilamelanogasterTED P Trichoplusia ni 17.6Drosophilamelanogaster297DrosophilamelanogastertornDrosophilaananassae yoyo Ceratitis capitata burdockDrosophilamelanogastergypsyDrosophilamelanogastergypsyDrosophilaobscura gypsyDrosophilavilils Osvaklo RT-RHDrosophila.

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Краснов, Алексей Николаевич
1. Введение.
2. Обзор литературы.
2.1. Общая характеристика и классификация мобильных элементов.
2.2. Молекулярная структура ретротранспозонов.
2.2.1. Общее строение.
2.2.2. Длинные концевые повторы.
2.2.3. Открытые рамки считывания.
2.2.4. 5' и 3' некодирующие регионы.
2.3. Перемещение ретротранспозонов в геноме.
2.3.1. Распределение ретротранспозонов по геному.
2.3.2. Механизм транспозиции.
2.3.3. Копийность ретротранспозонов.
2.3.4. Специфичность сайтов встраивания.
2.4. Транскрипция ретротранспозонов.
2.5. Взаимодействие ретротранспозонов с близлежащими генами.
2.6. Удлинение теломер у Drosophila melanogaster.
2.7. Структура и функциональные особенности рибосомных генов.
2.8. Копия ретротранспозонарепейник, обнаруженная в локусе cut.
3. Материалы и методы.
3.1. Объект исследования.
3.2. Бактериальные штаммы и плазмиды, использованные при 35 клонировании.
3.3. Ферменты и реактивы.
3.4. Бактериальные среды.
3.5. Молекулярно - биологические методы.
3.5.1. Выделение геномной ДНК.
3.5.2. Выделение тотальной РНК.
3.5.3. Гель-электрофорез ДНК.
3.5.4. Гель-электрофорез РНК.
3.5.5. Перенос ДНК на фильтр.
3.5.6. Электроэлюция ДНК из геля.
3.5.7. Введение радиоактивной метки в ДНК.
3.5.8. Southern гибридизация.
3.5.9. Обработка ДНК рестриктазами.
3.5.10. Лигирование ДНК.
3.5.11. Приготовление компетентных клеток.
3.5.12. Трансформация.
3.5.13. Щелочное выделение плазмидной ДНК.
3.5.14. Выделение фаговой ДНК.
3.5.15. PCR.
3.5.16. Скрининг фаговой библиотеки.
3.5.17. Гибридизация с колониями.
3.5.18. Рестриктное картирование.
3.5.19. Секвенирование.
3.5.20. Авторадиография, 44 3.6. Используемое программное обеспечение.
4. Результаты.
4.1. Геномный блот анализ репейника.
4.2. Клонирование разных копий репейника.
4.3. Нуклеотидная последовательность полной копии репейника.
4.4. Открытые рамки считывания полной копии репейника.
4.5. Сравнительный анализ различных копий репейника.
4.6. Начало транскрипции мобильного элемента репейник.
4.7. Места интеграции различных копий репейника.
5. Обсуждение.
5.1. Происхождение делегированных копий ретротранспозона 63 репейник.
5.2. Полная копия репейника может способствовать 63 перемещению делегированных копий.
5.3. Промоторная область репейника.
5.4. Специфичность мест интеграции репейника.
5.5. Интеграция репейника в рибосомные гены.
5.6. Эволюционное родство репейника.
6. Выводы.