Молекулярный механизм вовлечения фактора Paip2 в процесс экспрессии генов у Drosophila melanogaster Качаев Заур Мозырович

Краткое описание

Качаев,ЗаурМозырович.МолекулярныймеханизмвовлеченияфактораPaip2впроцессэкспрессиигеновуDrosophilamelanogaster: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.03 /КачаевЗаурМозырович; [Место защиты: Ин-т биологии гена РАН]. - Москва, 2019. - 117 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
Минобрнауки России Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологиигенаРоссийской академии наук на правах рукописиКачаевЗаурМозыровичМолекулярныймеханизмвовлеченияфактораPaip2впроцессэкспрессиигеновуDrosophilamelanogasterДиссертация на соискание учёной степени

стр. 4
3.2.2. ПривлечениеPaip2на промоторы экдизон-зависимыхгенов.................. 77 3.2.3. ПривлечениеPaip2нагентеплового шока ............................................... 81 3.2.4.Paip2связывается с ядерной мРНК ........................................................... 83 ГЛАВА 3.3. ОчисткаPaip2-содержащего белкового комплекса из ядерного эмбрионального экстракта D.melanogaster. Функциональное значениеPaip2в ядрах клеток....

стр. 13
International scientific conference "Science of the Future", 17-20 September 2014, St. Petersburg, Acta Naturae (2014) Special Issue, С. 79 6. З.М.Качаев, Ю.В. ШидловскийМолекулярныймеханизмвовлеченияфактораpaip2впроцессэкспрессиигеновуDrosophilamelanogaster. 17 Международная Пущинская школа-конференция

Оглавление диссертациикандидат наук Качаев Заур Мозырович
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность работы
Цель и задачи исследования
Научная новизна и практическая значимость работы
Личный вклад соискателя
Положения, выносимые на защиту
Степень достоверности и апробация результатов
Публикации
Тезисы конференций
1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
ГЛАВА 1.1. Модификации C-концевого домена РНК-полимеразы II (CTD)
1.1.1. CTD
1.1.2. Формирование преинициаторного комплекса
1.1.3. Фосфорилирование CTD РНК-пол II
1.1.4. Другие модификации CTD РНК-пол II
1.1.5. Динамика фосфорилирования CTD во время транскрипции
1.1.6. Модель capping checkpoint
ГЛАВА 1.2. мРНП и CBC комплексы
1.2.1. мРНП комплекс
1.2.2. Привлечение компонентов мРНП во время биогенеза мРНК
1.2.3. CBC комплекс, синтез 7mG
1.2.4. CBC и транскрипция
1.2.5. CBC и биогенез мРНК
ГЛАВА 1.3. Транспорт белков, локализация компонентов аппарата трансляции в ядрах
1.3.1. Импорт и экспорт белков
1.3.2. Компоненты аппарата трансляции в ядрах
ГЛАВА 1.4. Фактор Paip2
1.4.1. Paip2 - ингибитор трансляции
1.4.2. Участие Paip2 в других процессах
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
ГЛАВА 2.1. Линии клеток и мух
2.1.1. Штаммы Escherichia coli
2.1.2. Компетентные клетки и электропорация
2.1.3. Линия клеток Schneider 2 (S2) D. melanogaster
2.1.4. Трансфекция
2.1.5. РНК-интерференция
2.1.6. Линии мух
ГЛАВА 2.2. Методы работы с нуклеиновыми кислотами
2.2.1. ПЦР и количественный ПЦР в реальном времени (RT-qPCR)
2.2.2. Выделение РНК
2.2.3. Обратная транскрипция (RT-Reverse Transcription) - синтез кДНК
2.2.4. Синтез двуцепочечной РНК (дцРНК)
2.2.5. Клонирование
2.2.6. Список праймеров
ГЛАВА 2.3. Методы работы с рекомбинантными белками
2.3.1. Экспрессия белка индуктором - Изопропил^-0-1-тиогалактопиранозид (ИПТГ)
2.3.2. Аутоиндукция
2.3.3. Выделение рекомбинантных белков
2.3.4. Очистка и анализ белкового комплекса
2.3.5. Электрофорез белков в полиакриламидном геле (SDS/ПААГ)
2.3.6. Вестерн-блот анализ
2.3.7. Окрашивание белковых гелей Coomassie Blue R250
2.3.8. Окрашивание белковых гелей нитратом серебра
ГЛАВА 2.4. Иммунологические методы
2.4.1. Антитела, использованные в работе
2.4.2. Получение антител
2.4.3. Триазиновый метод посадки белка на сефарозу
2.4.4. Очистка антител на колонке с пришитым антигеном
2.4.5. Иммунопреципитация белков
2.4.6. Иммунопреципитация хроматина
2.4.7. Иммунопреципитация РНК
2.4.8. Иммуноокрашивание клеток
2.4.9. Приготовление препаратов политенных хромосом
2.4.10. Иммуноокрашивание семенников
3. РЕЗУЛЬТАТЫ
ГЛАВА 3.1. Белок Paip2 локализован в ядрах различных клеток
3.1.1. Paip2 в ядрах S2 клеток
3.1.2. Paip2 в ядрах других клеток D. melanogaster
ГЛАВА 3.2. Paip2 ассоциирован с промоторами активных генов посредством РНК
3.2.1. Локализация Paip2 на политенных хромосомах
3.2.2. Привлечение Paip2 на промоторы экдизон-зависимых генов
3.2.3. Привлечение Paip2 на ген теплового шока
3.2.4. Paip2 связывается с ядерной мРНК
ГЛАВА 3.3. Очистка Paip2-содержащего белкового комплекса из ядерного эмбрионального экстракта D. melanogaster. Функциональное значение Paip2 в ядрах клеток
3.3.1. Paip2 связан с факторами, локализующимися на промоторах активных генов
3.3.2. Paip2 и Cbp80 оказывают влияние на фосфорилированный серин 5 CTD РНК-пол II
3.3.3. Paip2 модифицируется PARP-полимеразой
4. ОБСУЖДЕНИЕ
Заключение
ВЫВОДЫ
Благодарности
Список литературы