Неканонические элементы нуклеотидной последовательности бактериальных промоторов и их роль в формировании транскрипционного комплекса Озолинь, Ольга Николаевна

Краткое описание

Озолинь,ОльгаНиколаевна.Неканоническиеэлементынуклеотиднойпоследовательностибактериальныхпромоторовиихрольвформированиитранскрипционногокомплекса: диссертация ... доктора биологических наук : 03.00.02. - Пущино, 1999. - 299 с.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
НАУК ^^:^^'"'^ZZZ.•^^.-, - А К Р о с с и и ^ - ИНСТИТУТ БИОФИЗИКИ КЛЕТКИ ^от:;ъД.ок:ги?А На правах рукописиОзолиньОльгаНиколаевнаНЕКАНОНИЧЕСКИЕЭЛЕМЕНТЫНУКЛЕОТИДНОЙПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИБАКТЕРИАЛЬНЫХПРОМОТОРОВИ ИХРОЛЬВФОРМИРОВАНИИТРАНСКРИПЦИОННОГОКОМПЛЕКСА(03.00.02 - Биофизика) Диссертация

стр. 31
взаимодействие с РНК-полимеразой, предполагая возможность их аддитивного вклада в процессформированиятранскрипционногокомплекса. Таким образом, канонические гексануклеотиды являются основнымиэлементамивегетативныхпромоторов, влияющими наформированиебинарныхкомплексовс РНКполимеразой, однако, эффективность этого взаимодействия зависит от контекста индивидуальныхпромоторови, следовательно, предполагает возможность использования...

стр. 80
аддитивности различных активаторных механизмов приформированииодноготранскрипционногокомплекса. Итак, существенно находится внуклеотиднаяотличается отпоследовательностьпоследовательности, с отсутствиемпромоторов, вегетативных гомологии в узнаваемыхпромоторов. Еа^*, Это соответствии аминокислотнойпоследовательностиа-фактора с а^^. Механизм активациипромоторовЕа^'^ также 80 отличается от механизма активации...

Оглавление диссертациидоктор биологических наук Озолинь, Ольга Николаевна
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ОСОБЕННОСТИ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 9 И СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ПРОМОТОРНОЙ ДНК (обзор литературы).
1. ОБЩАЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ И ЭНЗИМАТИЧЕСКАЯ 10 ХАРАКТЕРИСТИКА РНК-ПОЛИМЕР АЗЫ E.coli
2. САДИИ ТРАНСКРИПЦИОННОГО ЦИКЛА 15 3 СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ПРОМОТОРНОЙ ДНК
Канонические элементы - главные детерминанты промоторной ДНК
Длина спейсерного участка между каноническими элементами существенна для эффективного взаимодействия с РНК-полимеразой
Неканонические участки промоторной ДНК а) Последовательности нуклеотидов вокруг стартовой 38 точки транскрипции б) Особенности нуклеотидной последовательности 42 в участке между каноническим элементом -10 и стартовой точкой транскрипции в) Функциональное значение динуклеотида TG, 49 расположенного перед каноническим элементом г) Особенности структурной организации "upstream" 52 области промоторной ДНК
Формирование устойчивого изгиба в промоторной
ДНК, как фактор активации транскрипции
Взаимодействие "upstream" области промоторной
ДНК с а-субъединицами РНК-полимеразы
Особенности нуклеотидной последовательности промоторов активируемых альтернативными а-субъединицами а) Структурная организация и механизм активации промоторов, узнаваемых Eg' б) Особенности структурной организации и механизм 73 активации промоторов, узнаваемых Еа в) Особенности структурной организации и механизма активации промоторов, узнаваемых Еа
Конформационные изменения в промоторной ДНК, влияющие 82 на формирование транскрипционных комплексов а) Изменение суперспиральной плотности как фактор 82 регуляции транскрипции б) Вероятность образования крестообразных структур в 84 промоторной ДНК