Распознавание клеточной поверхности N4-подобными вирусами Прохоров, Николай Сергеевич

Краткое описание

Прохоров,НиколайСергеевич.РаспознаваниеклеточнойповерхностиN4-подобнымивирусами: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.03, 03.02.02 /НиколайСергеевичПрохоров; [Место защиты: Моск. гос. ун-т им. М.В. Ломоносова]. - Москва, 2017. - 113 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
Московский Государственный Университет имени М.В. Ломоносова На правах рукописиНиколайСергеевичПрохоровРаспознаваниеклеточнойповерхностиN4-подобнымивирусами03.01.03 молекулярная биология 03.02.02 вирусология ДИССЕРТАЦИЯ на соискание учёной степени кандидата биологических наук Научный руководитель

стр. 5
любое рациональное применениевирусовв качестве антибактериальных средств может быть основано только на глубоком понимании механизмов взаимодействиявирусови их хозяев, определяющих специфический характер инфекции. В первую очередь, механизмовраспознаванияклеточнойповерхностичувствительных штаммов

стр. 10
паразитической репликации в клетках. Поразительно, что поиск подходящего для воспроизведения хозяина,распознаваниеи связывание характеристических молекул наклеточнойповерхности, введение генома в клетку, подчинениеклеточногометаболизма, репликация и выражение генетического материала, сборка вирусных частиц,

Оглавление диссертациикандидат наук Прохоров, Николай Сергеевич
ВВЕДЕНИЕ..............................................................................................................................................4
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ........................................................................................................10
1.0. Три семейства хвостатых фагов.................................................................................................10
1.1. Длинные хвосты Myoviridae и Siphoviridae.................................................................................12
1.1.1. Трубка...........................................................................................................................................12
1.1.2. Чехол.............................................................................................................................................14
1.1.3. Базальные пластинки T4 и других сократимых систем...........................................................15
1.1.4. Базальные пластинки сифовирусов...........................................................................................21
1.2. Короткие хвосты Podoviridae......................................................................................................24
1.3. Распознавание клетки хвостатыми вирусами............................................................................25
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ...............................................................................................31
2.1. Фаги, бактерии и условия роста..................................................................................................31
2.2. Плазмиды и молекулярное клонирование.....................................................................................32
2.3. Экспрессия и очисткарекомбинантных белков..........................................................................34
2.4. Кристаллизация и определение структуры белков....................................................................36
2.5. Выделение и очистка липополисахаридов E. coli........................................................................36
2.6. ЯМР спектроскопия О-полисахаридов.........................................................................................37
2.7. Выделение фракции внешних мембран E. coli.............................................................................37
2.8. Тест на ингибирование фаговой адсорбции................................................................................37
2.9. Тест на инактивацию фага клеточным рецептором................................................................38
2.10. Тест на связывание клеточной поверхности рекомбинантными белками............................38
2.11. Взаимодействие gp63.1 и gp66 in vitro.......................................................................................39
2.12. Калориметрический анализ gp63.1.............................................................................................40
2.13. Получение нонсенс мутантов фага G7C по хвостовым шипам.............................................40
2.14. Криоэлектронная реконструкция фаговых частиц.................................................................41
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ......................................................................................42
3.1. Сравнение кластера структурных генов бактериофагов N4 и G7C........................................42
3.2. Pекомбинантные хвостовые шипы gp63.1 и gp66......................................................................44
3.3 Фонтанные мутанты E. coli 4s с устойчивостью к G7C........................................................47
3.4 Структура и активность gp63.1..................................................................................................55
3.5. Взаимодействие адгезинов gp63.1 и gp66 in vitro.......................................................................64
3.6. Cтруктура и активность gp66....................................................................................................67
3.7. Разработка протокола направленного мутагенеза фага G7C.................................................71
3.8. Организация адгезинов gp63.1 и gp66 в вирионе G7C.................................................................72
3.9. Консервативные элементы аппарата хвостовых шипов Ш-подобных вирусов.....................74
ВЫВОДЫ...............................................................................................................................................80
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ...................................................................................................................81
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ.....................................................................................................................82
ПРИЛОЖЕНИЕ 1..................................................................................................................................95
ПРИЛОЖЕНИЕ 2................................................................................................................................101
ПРИЛОЖЕНИЕ 3................................................................................................................................104