Роль белков hnRNP-K и Pcbp1 в плюрипотентных стволовых клетках мыши Бахмет Евгений Игоревич

Краткое описание

Бахмет,ЕвгенийИгоревич.РольбелковhnRNP-KиPcbp1вплюрипотентныхстволовыхклеткахмыши: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.03 /БахметЕвгенийИгоревич; [Место защиты: Институт цитологии Российской академии наук]. - Санкт-Петербург, 2019. - 90 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
ЦИТОЛОГИИ На правах рукописиБАХМЕТЕвгенийИгоревичРОЛЬБЕЛКОВHNRNP-K И PCBP1 ВПЛЮРИПОТЕНТНЫХСТВОЛОВЫХКЛЕТКАХМЫШИ03.01.03 Молекулярная биология

стр. 5
используемых сокращений ЭСК эмбриональныестволовыеклеткиЭпиПК эпибластоподобныестволовыеклеткиЭпиСК эпибластныестволовыеклеткиПСК плюрипотентныестволовыеклеткииПСК индуцированныеплюрипотентныеклеткиППК первичные половыеклеткиПААГ полиакриламидный гель ВКМ внутренняя клеточная

стр. 8
конкретном процессе. Настоящее исследование посвящено изучению функцийбелковhnRNP-K и Pcbp1 в регуляции экспрессии Oct4, равно как и ихроливплюрипотентныхстволовыхклеткахмышив целом. Цель и задачи исследования Целью данной работы является изучениеролибелковhnRNP-K и Pcbp1 вплюрипотентных

Оглавление диссертациикандидат наук Бахмет Евгений Игоревич
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность работы
Цель и задачи исследования
Основные положения, выносимые на защиту
Научная новизна
Теоретическое и практическое значение работы
Личный вклад автора
Апробация работы
Финансовая поддержка работы
Объем и структура диссертации
Список публикаций по теме работы
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Плюрипотентные стволовые клетки
1.1.1 Плюрипотентные стволовые клетки в эмбриогенезе
1.1.2 Наивная, промежуточная и праймированная плюрипотентность
1.2 Регуляция экспрессии Oct4
1.3 KH-доменные PolyC-связывающие белки
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Культивирование клеток
2.2 Хроматин-иммунопреципитация
2.3 Генные конструкции и их модификации
2.4 Нокаут и нокдаун генов
2.5 Трансфекция и трансдукция клеток
2.6 Выделение и количественный анализ РНК
2.7 Вестерн-блоттинг
2.8 Иммуноцитохимическое окрашивание клеток
2.9 Сортировка клеток и окрашивание для проточной цитометрии
2.10 Тератомный тест
2.11 Приготовление метафазных пластинок
2.12 Биоинформатическая обработка ChIP-seq и статистический анализ
Таблица 1. Использованные в работе олигонуклеотиды
Таблица 2. Использованные в работе антитела
Таблица 3. Использованные в работе опубликованные данные ChIP-seq. . . . 39 ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1 PolyC-связывающие белки как потенциальные регуляторы транскрипции гена Рвы5/1
3.2 Роль ЬпК№-К в ЭСК
3.2.1 Уровень hnRNP-K не влияет на экспрессию ОС4 в ЭСК и при их дифференцировке
3.2.2 Невозможность оверэкспрессии кпКЫР-К в ЭСК
3.2.3 кпКЫР-К является маркером открытого хроматина
3.3 Роль РсЬр1 в ЭСК
3.3.1 ЭСК, нокаутные по Pcbp1 жизнеспособны и остаются плюрипотентными
3.3.2 ЭСК, нокаутные по Pcbp1 гибнут во время перехода в праймированное
состояние
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ
4.1 Регуляция экспрессии гена Рвы5А
4.2 Значение каК^^ для плюрипотентных стволовых клеток
4.3 Значение Pcbp1 для ПСК
ВЫВОДЫ
Список литературы