Сравнительная характеристика белков FtsZ Escherichia coli и микоплазм Ведяйкин Алексей Дмитриевич

Краткое описание

Ведяйкин,АлексейДмитриевич.СравнительнаяхарактеристикабелковFtsZEscherichiacoliимикоплазм: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.03 /ВедяйкинАлексейДмитриевич; [Место защиты: Институт цитологии Российской академии наук]. - Санкт-Петербург, 2018. - 119 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
На правах рукописиВЕДЯЙКИНАлексейДмитриевичСРАВНИТЕЛЬНАЯХАРАКТЕРИСТИКАБЕЛКОВFtsZEscherichiacoliИМИКОПЛАЗМ03.01.03 молекулярная биология

стр. 4
Результаты и обсуждение ................................................................................. 70 4.1. Визуализация структур, формируемыхбелкомFtsZв клетках E.coli. 70 4.1.1. Метод локализационной микроскопии позволяет визуализироватьбелокFtsZи другие структуры внутри клетки E.coliс разрешением

стр. 4
.................................................................................................................. 91 4.6. Структуры, формируемыебелкамиFtsZM. gallisepticum и A. laidlawii в клетках E.coli............................................................................................................ 93 4.7.Белки, взаимодействующие сбелкамиFtsZмикоплазмв клетках E.coli...

Оглавление диссертациикандидат наук Ведяйкин Алексей Дмитриевич
1.1. Актуальность работы
1.2. Методы исследования
1.3. Цель и задачи работы
1.4. Научная новизна и практическая ценность работы
1.5. Положения, выносимые на защиту
1.6. Апробация работы и публикации
1.7. Личный вклад автора
1.8. Структура и объем работы
1.9. Финансовая поддержка работы
2. Литературный обзор
2.1. Механизмы деления бактерий
2.1.1. Гены деления в бактериальном геноме
2.1.2. Структура и состав бактериальной дивисомы E. coli
2.1.3. Структура и состав дивисомы других видов бактерий
2.1.3. Свойства белка FtsZ в условиях in vitro
2.1.3. Механизмы регуляции бактериального деления
2.1.4. FtsZ как мишень для новых антибактериальных препаратов
2.1.5. Механизмы деления микоплазм
2.2. Методы микроскопии сверхвысокого разрешения
2.2.1. Детерминистские методы визуализации
2.2.2. Стохастические методы визуализации
3. Материалы и методы
3.1. Подготовка фиксированных клеток E. coli для микроскопии сверхвысокого разрешения
3.2. Подготовка живых клеток E. coli для микроскопии сверхвысокого разрешения
3.3. Подготовка фиксированных клеток M. gallisepticum и A. laidlawii для микроскопии сверхвысокого разрешения
3.4. Подготовка фиксированных клеток M. gallisepticum и A. laidlawii для иммуноэлектронной микроскопии
3.5. Микроскопия сверхвысокого разрешения (методы SMLM и SRRF)
3.5.1. Двухмерная и трехмерная микроскопия SMLM, SRRF, а также стандартная флуоресцентная микроскопия фиксированных клеток E. coli, M. gallisepticum и A. laidlawii
3.5.2. Локализационная микроскопия и микроскопия SRRF с использованием живых клеток E. coli
3.5.3. Анализ размеров кластеров FtsZ
3.6. Электронная микроскопия
3.7. Ко-иммунопреципитация белков, взаимодействующих с белками FtsZ M. gallisepticum и A. laidlawii
3.8. Со-осаждение белков, взаимодействующих с белками FtsZ M. gallisepticum и A. laidlawii в клетках E. coli
3.9. Получение поликлональных антител к белкам FtsZ M. gallisepticum и A. laidlawii
3.9.1. Очистка рекомбинантных белков FtsZ
3.9.2. Иммунизация животных
3.9.3. Очистка и тестирование антител
3.9.4. Оценка концентрации белков FtsZ в клетках микоплазм
3.10. Визуализация FtsZ в живых клетках M. gallisepticum при помощи эндогенно-экспрессируемой флуоресцентной метки
4. Результаты и обсуждение
4.1. Визуализация структур, формируемых белком FtsZ в клетках E. coli
4.1.1. Метод локализационной микроскопии позволяет визуализировать белок FtsZ и другие структуры внутри клетки E. coli с разрешением до 20 нм
4.1.2. Z-кольцо - неоднородная структура
4.1.3. Анализ структур, формируемых белком FtsZ в ходе восстановления деления после филаментации клеток
4.3. Тестирование антител к белкам FtsZ M. gallisepticum и A. laidlawii, оценка концентрации FtsZ в клетках микоплазм
4.4. Структуры, формируемые белками FtsZ в клетках M. gallisepticum и A. laidlawii
4.5. Белки, взаимодействующие с белками FtsZ в клетках M. gallisepticum и A. laidlawii
4.6. Структуры, формируемые белками FtsZ M. gallisepticum и A. laidlawii в клетках E. coli
4.7. Белки, взаимодействующие с белками FtsZ микоплазм в клетках E. coli
4.8. Локализация белка FtsZ в живых клетках M. gallisepticum
5. Заключение
6. Выводы
7. Список сокращений и условных обозначений
8. Список литературы
Благодарности