Статистическое обеспечение радиационного гибридного картирования Свищева, Гульнара Рустамовна

Краткое описание

Анисимов,АнатолийИванович.ОбоснованиегенетическихметодовборьбысвреднымивидаминасекомыхизотрядовDipteraиLepidoptera: диссертация ... кандидата биологических наук в форме науч. докл. : 03.00.15. - Санкт-Петербург, 1997. - 48 с. : ил.; 20х15 см.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ На правах рукописи УДК: 575.01+632.93:[575.632.7]АнисимовАнатолийИвановичОБОСНОВАНИЕГЕНЕТИЧЕСКИХМЕТОДОВБОРЬБЫСВРЕДНЫМИВИДАМИНАСЕКОМЫХИЗОТРЯДОВDIPTERAИLEPIDOPTERA. Специальности: 03.00.15 - генетика, 03.00.09 - энтомология ДИССЕРТАЦИЯ ввиденаучного доклада на соискание ученой степени доктора биологических наук Санкт-Петербург, 1997 г....

стр. 7
наследственностью увредныхвидовизотрядовDipteraиLepidopteraс неразрабо­ танной частной генетикой, выпуск которых более эффективен, чем использование пол­ ностью стерилизованных особей при осуществлениигенетическогометодаборьбы. 1, Постановка проблемы.Генетическиеметодыборьбысвреднымичленистоногими

стр. 41
особенно гомозиготных. Однако, их нулевая эффективность в первом поколении делает использование самих по себе линий с одной транслокацией длягенетическойборьбыс представителямиотрядаLepidopteraмало рациональным. С целью выявления наиболее эффективных вариантовгенетическогометодаборьбысвредныминасекомымимы разработали компьютерные программ, позволяющие моде­ лировать выпуск мутантныхнасекомыхпри их дополнительном...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Свищева, Гульнара Рустамовна
Введение
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Радиационное гибридное картирование
1.1.1. Биологические принципы метода РГ- картирования. 10 Получение эмпирических данных
1.1.2. Сравнение РГ- метода с другими методами 11 картирования
1.1.3. Практическое применение РГ- картирования
1.2. Статистические методы РГ- картирования
1.2.1. Непараметрические методы
1.2.1.1. Метод конкордантности пар генов (Метод 1)
1.2.1.2. Метод парных корреляций (Метод 2)
1.2.1.3. Метод совместного перемещения пар генов 20 (Метод 3)
1.2.1.4. Метод минимума обязательных разрывов 21 (Метод 4)
1.2.1.5. Алгоритмы поиска порядка с минимальным 22 числом разрывов
1.2.1.5.1. Метод ветвей и границ
1.2.1.5.2. Пошаговое упорядочивание локусов
1.2.1.5.3. Инверсия блоков генов
1.2.2. Параметрические методы
1.2.2.1. Метод попарного сравнения (Метод 5)
1.2.2.2. Метод максимума правдоподобия (Метод 6)
1.2.2.3. Метод максимума апостериорных вероятностей 28 (Метод 7)
1.2.2.4. Вероятностные модели 30 1.2.2.4.1. Марковское свойство
1.2.2.4.2. Модель с движущимся средним 31 значением
1.2.2.4.3. Модель равных вероятностей сохранения 31 фрагментов
1.2.2.4.4. Центромерная или теломерная модель
1.2.2.4.5. Модель крайнего гена
1.2.2.4.6. Селективные модели 32 1.2.3. Заключение и постановка задачи
Глава 2. Статистические методы РГ-картирования комбинированной 36 группы генов
2.1. Новый тип селективных моделей и их свойства
2.1.1. Обобщенная вероятностная модель
2.1.1.1. Параметры модели
2.1.1.2. Совместное распределение вероятностей генов в 38 гибридных клонах
2.1.2. Свойства селективных моделей
2.1.2.1. Аддитивность и Марковское свойство
2.1.2.2. Число достаточных переменных
2.2. Статистические критерии для выбора правильного порядка и 45 их свойства
2.2.1. Общие принципы построения статистических 45 критериев
2.2.1.1. Критерий х
2.2.1.2. Критерий отношения правдоподобия
2.2.2. Специфика задачи РГ-картирования генов
2.2.3. Построение статистического критерия для выбора 48 правильного порядка
2.2.3.1. Выбор статистики
2.2.3.2. Плотность распределения статистики
2.2.3.2.1. Стохастическое моделирование
2.2.3.2.2. Общий вид распределений статистик АЕ 54 и АЬЬ
2.2.3.3. Анализ распределения и определение граничных 54 значений критериев
2.2.3.3.1. Критерий для решения первого класса 55 задач
2.2.3.3.2. Критерий для решения второго класса 62 задач (априорная вероятность правильного порядка)
2.2.3.3.3. Апостериорная вероятность выбора 63 правильного порядка