Стереохимический анализ полярных взаимодействий в α-спиральных белках Кондратова, Мария Сергеевна

Краткое описание

Кондратова,МарияСергеевна.Стереохимическийанализполярныхвзаимодействийвα-спиральныхбелках: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Пущино, 2006. - 103 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
61:06-3/643 На правах рукописи РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТБЕЛКАМОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В. ЛОМОНОСОВАКОНДРАТОВАМАРИЯСЕРГЕЕВНАСТЕРЕОХИМИЧЕСКНЙАНАЛИЗНОЛЯРНЫХВЗАИМОДЕЙСТВИЙВ а-СИИРАЛЬНЫХБЕЛКАХ(специальность 03.00.03 - молекулярная биология) Диссертация на соискание

стр. 34
белковявляется изучение мембранныхбелкови их модельных аналогов. 1.2.4.аПолярныевзаимодействия, формирование белковых комплексов и олигомеризация сс-белков.Полярныевзаимодействияиграют важную роль в формировании четвертичной структурыбелков,белок-белковом узнавании и организации сложных надмолекулярных

стр. 35
излюбленным модельным объектом для изучения вкладаполярныхвзаимодействийв формировании нативной структурыбелкастали сс-белки. Хотя вклад межспиральныхполярныхвзаимодействийв стабильность сс-белкови меньше вклада гидрофобныхвзаимодействий[78, 79], во многих случаях именнополярныевзаимодействия

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Кондратова, Мария Сергеевна
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР.
1.1 Упаковка длинных а-спиралей в белках.
1.2 Гидрофильные взаимодействия в белках.
ГЛАВА 2. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ.
2.1 Постановка задачи.
2.2 Спрятанные гидрофильные остатки в белках как фактор, определяющий нативную упаковку спиралей.
2.3 Стереохимический анализ гидрофильных взаимодействий в а-спиральных белках с различными упаковками а-спиралей.
2.4 Взаимосвязь между геометрическими параметрами межспиральных водородных и солевых связей и типами остатков, которые в них участвуют.
2.5 Моделирование «нативных» и «ненативных» межспиральных взаимодействий.
2.6 Вероятность образования разных типов межспиральпых связей. Вероятность образования межспиральных солевых мостиков в зависимости от доступности заряженных остатков. Доступность доноров и акцепторов в межспиральных связях.