Структурно-функциональный анализ промоторных областей гена oct-1 мыши Сытина, Елена Вячеславовна

Краткое описание

Сытина,ЕленаВячеславовна.Структурно-функциональныйанализпромоторныхобластейгенаoct-1мыши: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03. - Москва, 2005. - 101 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
:0S'2>I^03Z РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ имени В.А.ЭНГЕЛЬГАРДТА На правах рукописиСЫТИНАЕленаВячеславовнаУДК 577.27: 577.212Структурно-функциональныйанализпромоторныхобластейгенаoct-lмышиСпециальность 03.00.03 - молекулярная биология Диссертация на соискание ученой

стр. 3
5'-нетранслируемыхобластейгенаoct-1мыши. . . 3.1 Клонирование 5'-нетранслируемыхобластейгенаoct-1мышиперед экзоном 1L 3.2 Клонирование 5'-нетранслируемыхобластейгенаoct-1мышиперед экзоном 1U 4. Футпринтинг 5. Создание репортерных плазмид Результаты исследования 1. Экзон-интронная структурагенаOct-1мыши

стр. 4
этом ничего не известно о (4* регуляции экспрессии самогогенаoct-1. Данная работа посвященаанализу5промоторныхобластейгенаoct-1мыши, поиску возможных механизмов регуляции экспрессиигенаэтого полифункционального фактора. Список обозначений и сокращений ГМ-КСФ - гранулоцитарно-макрофагальный

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Сытина, Елена Вячеславовна
щ Введение.
Список обозначений и сокращений.
Литературный обзор.
1. Инициация транскрипции эукариотической РНК-полимеразой II.
1.1 Элементы последовательности ДНК, участвующие в инициации транскрипции РНК-полимеразой II.
1.2 Общие транскрипционные факторы РНК-полимеразы II.
1.3 Медиатор РНК-полимеразы II.
2. Oct-1 - полифункциональный фактор.
2.1 Строение белка Oct-1.
2.2 Взаимодействие Oct-1 с участками связывания.
2.3 Альтернативный сплайсинг Oct-1 пре-мРНК.
2.4 Взаимодействие Oct-1 с факторами транскрипции и коактиваторами
2.5 Фосфорилирование Oct-1 в клеточном цикле.
2.6 Взаимодействие Oct-1 с белками HMG.
2.7 Взаимодействие Oct-1 с белками ядерного матрикса.
2.8 Участие Oct-1 в репликации ДНК. . .-г
2.9 Участие Oct-1 в эмбриональном развитии, морфогенезе и дифференцировке клеток.
2.10 Oct-1, иммунная система и гемопоэз.
2.11 Oct-1 и эндокринная система.
Цели и задачи исследования.
Материалы и методы.
1. Реактивы и материалы.
2. Стандратные методы.
2.1 Выделение плазмидной ДНК с тритоном Х-100.
2.2 Получение компетентных клеток.
2.3 Трансформация.
2.4 Мечение ДНК.
2.5 Получение клеточных экстрактов из клеток миеломы NS/0.
2.6 Задержка подвижности в геле комплексов ДНК-белок. 2.7 Выделение больших количеств суперскрученной плазмиды с очисткой bCsCI.
2.8 Рестрикция.
2.9 Лигирование.
2.10 Электрофорез ДНК в агарозном геле.
• 2.11 Выделение ДНК из легкоплавкой агарозы.
2.12 Культивирование клеток.
2.13 Транзиентная трансфекция и определение люциферазной активности
3. Клонирование 5'-нетранслируемых областей гена oct-1 мыши
3.1 Клонирование 5'-нетранслируемых областей гена oct-1 мыши перед экзоном 1L.
3.2 Клонирование 5'-нетранслируемых областей гена oct-1 мыши перед экзоном 1U.
4. Футпринтинг.
5. Создание репортерных плазмид.
Результаты исследования.
1. Экзон-интронная структура гена Oct-1 мыши и человека.
2. Клонирование и анализ 5'-областей перед экзонами 1U и 1L
3. Поиск сайтов связывания, потенциально способных участвовать в ауторегуляции гена Oct-1.
3.1 Анализ ДНК-белковых комплексов методом задержки подвижности в геле.
3.2 Поиск методом футпринтинга сайтов связывания, потенциально способных участвовать в ауторегуляции гена Oct
4. Изучение промоторной активности 5'-областей перед экзонами
IUhIL в клетках линии фибробластов 10(1).
V/ 4.1 Определенте активности промоторов 1U и 1L.
4.2Функциональный анализ 5'-фланкирующей области экзона 1L . . . .71 4.3Изучение активности промоторов 1U и 1L в лимфоидных и нелимфоидных клетках.
Обсуждение результатов.
Выводы.