Структурно-конформационные состояния и спектральные характеристики каротиноида в фотоцикле оранжевого каротиноидного белка цианобактерий Ярошевич Игорь Александрович

Краткое описание

Ярошевич,ИгорьАлександрович.Структурно-конформационныесостоянияиспектральныехарактеристикикаротиноидавфотоциклеоранжевогокаротиноидногобелкацианобактерий: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.01.02 /ЯрошевичИгорьАлександрович; [Место защиты: ФГБОУ ВО «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова»]. - Москва, 2020. - 94 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ имени М.В.ЛОМОНОСОВА БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ На правах рукописиЯрошевичИгорьАлександровичСтруктурно-конформационныесостоянияиспектральныехарактеристикикаротиноидавфотоциклеоранжевогокаротиноидногобелкацианобактерий03.01.02 - Биофизика ДИССЕРТАЦИЯ

стр. 2
каротиноидах................................................................................................8 1.1.1 Основное электронноесостояниекаротиноидовS0 и их конформация.......................11 1.1.2 Низшие возбужденные электронныесостояниякаротиноидов.....................................14 1.1.2.1 Кинетика низших возбужденных электронныхсостоянийкаротиноидов............19 1.1.2.2 Влияние локального окружения и конформации на...

стр. 5
использована вычислительная квантовая химия. 5 Цели и задачи исследования Целью работы является изучение методами вычислительной квантовой химии механизмаструктурно-конформационныхизменений испектральныххарактеристиккаротиноидав составе фоторецептора ОСР. Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи: 1. Исследовать характерконформационныхпереходов в сопряженной цепикаротиноидаи соответствующий энергетический профиль в...

Оглавление диссертациикандидат наук Ярошевич Игорь Александрович
Введение
Цели и задачи исследования
Научная новизна и практическая значимость работы
Личный вклад автора
Положения, выносимые на защиту
Апробация работы
Публикации
Глава 1. Обзор литературных данных
1.1 Общие сведения о каротиноидах
1.1.1 Основное электронное состояние каротиноидов S0 и их конформация
1.1.2 Низшие возбужденные электронные состояния каротиноидов
1.1.2.1 Кинетика низших возбужденных электронных состояний каротиноидов
1.1.2.2 Влияние локального окружения и конформации на спектральные свойства каротиноидов
1.1.3 Протонированные формы каротиноидов
1.2 Белковые комплексы с каротиноидами
1.2.1 Оранжевый каротиноидный белок (ОСР)
1.2.2 Фотоцикл ОСР
1.2.3 Механизм фотоактивации ОСР
Глава 2. Методы исследования
2.1 Вид волновой функции и базисное пространство для поиска волновой функции
2.1.1 Метод BSSE
2.2 Метод самосогласованного поля (ССП)
2.2.1 Метод Хартри-Фока-Рутаана
2.2.2 Учет конфигурационного взаимодействия
2.2.3 Теории Функционала Плотности (DFT)
2.2.3.1 Учет дисперсионного взаимодействия D3
2.2.4 Теории Функционала Плотности, Зависящей от Времени (TDDFT)
2.3 Оценка энергии водородной связи в возбужденном состоянии
2.4 Реализация методов исследования
Глава 3. Результаты и обсуждение
3.1 Конформация основного электронного состояния каротиноидов
3.2 Энергия водородной связи с кетогруппой каротиноида в основном электронном состоянии S0
3.3 Расчет энергии возбужденных электронных состояний каротиноидов
3.3.1 Функциональная интерпретация полученных результатов
3.3.2 Влияние конформации каротиноида на сдвиг оптического спектра поглощения
3.4 Альтернативные механизмы разрыва водородной связи на первичном этапе фотоактивации ОСРо
3.5 Влияние внешнего электростатического поля на сродство к протону кетогруппы каротиноида РАе™
3.5.1 Влияние белкового окружения на энергию переноса протона на каротиноид
4. Заключение
Выводы
Список рецензированных работ, опубликованных автором по теме диссертации
Список литературных источников