Структуры комплексов бактериальных формиатдегидрогеназ с коферментом и субстратом Филиппова, Екатерина Валерьевна

Краткое описание

Филиппова,ЕкатеринаВалерьевна.Структурыкомплексовбактериальныхформиатдегидрогеназскоферментомисубстратом: диссертация ... кандидата физико-математических наук : 03.00.03. - Москва, 2006. - 110 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
06-1 61:06-1/1242 РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ имени В.А. Энгельгардта 1242ФилипповаЕкатеринаВалерьевнаСТРУКТУРЫКОМПЛЕКСОВБАКТЕРИАЛЬНЫХФОРМИАТДЕГИДРОГЕНАЗСКОФЕРМЕНТОМИСУБСТРАТОМДиссертация на соискание учёной степени кандидата физико-математических наук Снецнальность

стр. 3
Pseiidomonas sp.lOlСтруктураформиатдегидрогеназывкомплексес формиат-иоиом Струг<турь[ мутаитных формформиатдегидрогеназыКристаллическаяструктурановойформиатдегидрогеназыиз бактерий Moraxella sp.C2 I 3.4.1. Кристаллическаяструктуракомплексаформиатдегидрогеназыиз бактерий Moraxella sp.C2 с формиатом

стр. 11
[8] и FDHP [17]. Для HicDH [14] известнаструктуратройногокомплексаскоферментомисубстратом(2гидроксиизокапроатом). Для DLDH2 и FDFIP известнаструктуратройногокомплексаскоферментоми ингибитором, оксаматом и азид-ионом, соответственно [17].Структурадвойногокомплексаскоферментом(NAD') была

Оглавление диссертациикандидат физико-математических наук Филиппова, Екатерина Валерьевна
Введение.
1. Обзор литературы
1.1. Рентгеноструктурное исследование D - специфичных дегидрогеназ 2-гидрокси кислот.
1.1.1. Структура D - специфичных дегидрогеназ.
1.1.2. Связывание кофермента (NAD+) и субстратов с D-специфичными дегидрогеназами.
1.2. Структура ЫАО+-зависимой формиатдегидрогеназы из метилотрофных бактерий Pseudomonas sp.IOl.
1.2.1. Общая характеристика бактериальных NAD '-зависимых формиатдегидрогеназ.
1.2.2. Пространственные структуры апо- и холо-формы формиатдегидрогеназы Сравнение со структурами D-специфичных дегидрогеназ.
1.2.3. Структура активного центра холо-формы формиатдегидрогеназы.
1.2.4. Модель связывания формиат-иона в активном центре фермента.
2. Материалы и методы исследования
2.1. Получение кристаллов комплексов формиатдегидрогеназы из бактерий Pseudomonas sp. 101 и Morcixella sp.C2.
2.2. Сбор и обработка дифракционных данных.
2.3. Решение и уточнение структур.
2.4. Съемка и обработка данных малоуглового рассеяния.
3. Результаты и их обсуждение
3.1. Новая кристаллическая модификация апо-формы формиатдегидрогеназы из бактерий Psendomonas ар. 101.
3.2. Структура формиатдегидрогеназы в комплексе с формиат-ионом.
3.3. Структуры мутантных форм формиатдегидрогеназы.
3.4. Кристаллическая структура новой формиатдегидрогеназы из бактерий Moraxella sp.C2.
3.4.1. Кристаллическая структура комплекса формиатдегидрогеназы из бактерий Moraxella sp.C2 с формиатом.
3.4.2. Кристаллическая структура комплекса формиатдегидрогеназы из метилотрофных бактерий Moraxella sp.C2 с NAD1 и азид-ионом.
3.5. Исследование свободного фермента, двойных и тройных комплексов формиатдегидрогеназы методом малоуглового рентгеновского рассеяния.
Основные результаты работы и выводы.