Выявление и изучение клеточных функций Escherichia coli, участвующих в генетическом контроле развития бактериофагов Синеокий, Сергей Павлович

Краткое описание

Синеокий,СергейПавлович.ВыявлениеиизучениеклеточныхфункцийEscherichiacoli,участвующихвгенетическомконтролеразвитиябактериофагов: диссертация ... доктора биологических наук : 03.00.15. - Москва, 1999. - 143 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
ГОСУДАРСТВЕННЫЙ 1-1АУЧН0-ИССЛЕД0В АТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ГЕНЕТЖИ И СЕЛЕКЦИИ ПРОМЫШЛЕННЫХ Ml ТООРГАНИЗМОВ На правах рукописи Экз. N2СИНЕОКИЙСергейПавловичВЫЯВЛЕНИЕИИЗУЧЕНИЕКЛЕТОЧНЫХФУНКЦИЙESCHERICHIACOLI, У Ч А С Т В У Ю Щ И Х В Г Е Н Е Т И Ч Е С К О МКОНТРОЛЕРАЗВИТИЯБАКТЕРИОФАГОВ. 03.00.15 -

стр. 4
выявленияфенотипических изменениях, по-прежднему,генетическогоконтролямногихклеточныхфункций. Одним из общих подходовгенетическогоизученияЕ.соН являетсявыявлениеклеточныхгенов, влияющих на различные этапыразвитиябактериофагов. Эффективность этого подхода связана с тем, чторазвитиебактериофагов

стр. 8
наши представления о многообразии взаимодействия фаговых иклеточныхфункций, регулируемости различных этаповразвитиявирулентных и умеренныхбактериофаговклеточнымигенами, позволяющих рассматриватьбактериофаги, фактически, какгенетическиеэлементы клетки способные осзш^ествлять внутри- и межвидовойгенетическийобмен, эффективность которого регулируется клеткой и зависит от ее состояния. 7 II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ. Данный обзор литературы...

Оглавление диссертациидоктор биологических наук Синеокий, Сергей Павлович
I. ВВЕДЕНИЕ.
II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. Белки клеточной стенки E.coli, участвующие в фаговой адсорбции и транспорте колицинов.
1.1. Пориновые белки.
1.2. Белки-рецепторы фагов и колицинов, участвующие в специфическом транспорте.
1.3. Транспорт колицинов.
1.4. ТопВ иТо1А -зависимые транспортные системы и импорт макромолекул в E.coli.
1.5. Участие белков ЕхЬВ и ExbD в ТопВ зависимом транспорте.
1.6. Продукты генов tol и импорт макромолекул в Е. coli.
1.7. Механизм транспорта макромолекул системой Tol.
1.8. Взаимозаменяемость белков TonB-ExbB-ExbD и TolA-TolQ-TolR.
1.9. Многостадийность фаговой инфекции.
2. Элементы системы адаптация клеток Escherichia coli к воздействиям окружающей среды
2.1. SOS система.:.„.
2.2. Регуляция синтеза капсульного полисахарида.
2.2.1. Основные элементы регуляции синтеза колановой кислот.
2.2.2. RcsC и RcsB как пара сенсор - эффектор.
2.2.3. Протеаза Lon контролирует уровень RcsA.
2.2.4. Стимуляция транскрипции генов cps зависит от взаимодействия RcsA с RcsB.
2.2.5. Модель регуляции синтеза клеточной капсулы.
2.3. Переход в стационарную фазу как последняя стадия адаптивного ответа.
2.3.1. RpoS -зависимые гены.
2.3.2. RpoS-зависимые гены могут быть элементами других регуляторных систем.
2.3.3. Регуляция гена RpoS.
2.3.4. Как RpoS контролирует экспрессию генов.
III. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
1. Бактериальные штаммы, плазмиды и бактериофаги.
2. Питательные среды и реактивы.
3. Перенос мутации из плазмиды в хромосому.
4. Генетические методы конструирования штаммов.
5. Проверка утилизации витамина В12.
6. Методы работы с ДНК.
7. Фракционирование компонентов оболочки клеток.
8. Анализ клеточных бел::ов.
9. Анализ адсорбции фага С1.
10. Комплементационный анализ мутантов по фаговой адсорбции.
11. Качественное и количественное определение эффективности индукции профага ля. j'a.
12. Спот-тест и количественное определение эффективности индукции профага А,.
13. Определение эффективности адсорбции фага лямбда.
IV. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
1. Изучение клеточного генетического контроля адсорбции бактериофага С1.
1.1. Выделение бактериофага С1 и получение мутантов Е, coli, дефектных по адсорбции фага С1.
1.2. Клонирование генов а^гА и dcrB.
1.3. Локализация генов der А и dcrB внутри клонированных фрагментов
ДНК и на физической карте E.coli.
1.4. Анализ нуклеотидной последовательности генов der А и dcrB.
1.5. Оперонная организация экспрессии гена dcrB.
1.6. Идентификация продукта гена dcrB.
1.7. Локализация белка DcrB в мембранных фракциях.
1.8. Продукт гена dcrA не влияет на экспрессию dcrB.
1.9. Утилизация витамина В12 в мутантах dcrB и dcrA.
1.10. Плейотропные эффекты, вызванные инактивацией или увеличением дозы гена dcrA в клетке.
1.11. Построение модели адсорбции бактериофага С1.
1.12. Изучение участков бактериальной хромосомы на 63.1 и 77.8 минутах карты E.coli, прилегающих к генам dcrA и dcrB.
2. Изучение SOS-незавкшмых клеточных функций, контролирующих индукцию лямбдоидных фагов.
2.1. Клонирование генов Escherichia coli, сверхэкспрессия которых приводит к RecA- независимой индукции профага лямбда.
2.2. Избыток RcsA и DsrA в клетке приводит к RecA-незавиеимой индукции профага лямбда.
2.3. Влияние сверхпродукции RcsA и DsrA на индукцию других лямбдоидных фагов.
2.4. Количественное определение эффективности RecA-незавиеимой индукции профага лямбда.
2.5. Роль генов rcsA,rcsB и dsrA в RecA-незавиеимой индукции профага лямбда.
2.6. Эффективность RcsABC пути индукции профага лямбда при сверхпродукции cI-Я. репрессора.
2.7. Индукция профагов - естестенный ответ клетки на различные стрессовые воздействия.