Закономерности и биологические эффекты процесса транспозиций ретранспозонов в геноме Drosophila melanogaster Пасюкова, Елена Генриховна

Краткое описание

Пасюкова,ЕленаГенриховна.ЗакономерностиибиологическиеэффектыпроцессатранспозицийретранспозоноввгеномеDrosophilamelanogaster: диссертация ... докторабиологическихнаук : 03.00.15. - Москва, 1999. - 194 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
Российская Академия Наук Институт молекулярной генетикиПАСЮКОВАЕЛЕНАГЕНРИХОВНАЗАКОНОМЕРНОСТИИБИОЛОГИЧЕСКИЕЭФФЕКТЫПРОЦЕССАТРАНСПОЗИЦИЙРЕТРОТРАНСПОЗОНОВ ВГЕНОМЕDROSOPHILAMELANOGASTERД И С С Е Р Т А Ц И Я НА С О И С К А Н И Е У Ч Е Н О Й С Т Е П Е Н И Д О К Т О Р А Б И О Л О Г И Ч Е С К И

стр. 9
проблеме. Принимая во внимание тот факт, чтопроцесстранспозицийявляется основным характерологическим свойством МЭ, целю настоящей работы было выбрано изучениезакономерностейибиологическихэффектовпроцессатранспозицийМЭ вгеноме. На наш взгляд, наибольший интерес среди всех типов МЭ представляют

стр. 33
гистонами in vitro (Picologlou et al., 1990). Мутация в этом гене приводит к 100-кратному увеличению частотытранспозицийТу1. Другой ген это ген т-PHK'^''^, гиперэкспрессия которого снижает частотутранспозицийТу1 (Хи, Воеке, 1990). 33 уDrosophilaflamenco,melanogasterисключение составляет, пожалуй,

Оглавление диссертациидоктор биологических наук Пасюкова, Елена Генриховна
ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. Классификация, структура и свойства МЭ
Ретротранспозоны
Ретропозоны (!-^Е-элементы)
Транспозоны
РВ-элементы
2. Ретротранспозоны как источник генетической изменчивости
3. Саморегуляция активности ретротранспозонов
4. Геномные факторы, регулирующие активность ретротранспозонов 31 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Линии дрозофилы
Системы скрещиваний
- Изогенизация
- Совмещения хромосом разных линий
- Получение рекомбинантных инбредных линий 43 Оценка компонентов приспособленности
- Определение индекса конкуренции
- Определение выживаемости яиц 46 Измерение частоты мутаций
- Определение частоты сцепленных с полом леталей
- Определение частоты сцепленных с полом видимых мутаций
Основные растворы и используемые сокращения
Методы работы с ДНК
- Выделение плазмидной ДНК
- Выделение геномной ДНК Drosophila melanogaster
- Выделение ДНК фага М13
- Ферментативная обработка ДНК
- Гель-электрофорез и элюция фрагментов ДНК
- Трансформация и трансфещия
- Введение метки в ДНК
- Саузерн-блот анализ
- Полимеразная цепная реакция
- Определение нуклеотидной
последовательности ДНК
Методы работы с РНК
- Выделение РНК
- Гель-электрофорез
- Введение метки в РНК
- Нозерн-блот анализ
- Определение относительных количеств РНК copia 59 Определение сайтов локализации МЭ на хромосомах
- Изготовление цитологических препаратов
- Гибридизация in situ 61 Оценка числа копий МЭ в геноме
- Гаплоидное число копий 63 -Диплоидное число копий
Измерение частоты транспозиций
Р-зависимая трансформация эмбрионов
- Оборудование для инъекций
- Получение и анализ трансформантов 70 Статистическая обработка данных
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 75 1. Экспериментальные модельные системы, использованные в
работе, и общая характеристика процесса транспозиций в них
Линия НА
Скрещивания с использованием хромосом-балансеров
Линяи 2Ь
Линия Harwich
2. Ретротранспозоны как источник генетической изменчивости
Инсерционный мутагенез
- Частота мутаций в линии 2Ь
- Спектр транспозиций 94 Влияние инсерций ретротранспозонов на
приспособленность
- Распределение ретротранспозонов по хромосомам
в природных популяциях
- Изменение частоты транспозиций, числа копий copia и приспособленности особей в
инбредных сублиниях 2Ь
- Число копий ретротранспозонов и
приспособленность в линиях 2Ь и Harwich
- Закономерности изменения локализации мдг1, коррелирующего с изменением приспособленности,
в линии НА и ее производных
3. Саморегуляция активности ретротранспозонов
Зависимость частоты транспозиций ретротранспознов от числа их копий в геноме
Нуклеотидные последовательности активно перемещающихся ретротранспозонов
4. Геномные факторы, регулирующие активность ретротранспозонов
Сопряженность процессов транскрипции и транспозиции
- Количество транскрипта copia в линиях, характеризующихся различной частотой транспозиций
- Уровень транскрипции и частота транспозиций copia
у самцов и самок
- Согласованные изменения количества транскрипта и частоты транспозиций copia у самцов разного возраста
Картирование районов хромосом, контролирующих высокую частоту транспозиций и количество транскрипта copia
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ -