Электронномикроскопическое исследование структуры хроматина разных уровней организации Попенко, Владимир Иванович

Короткий опис

Попенко,ВладимирИванович.Электронномикроскопическоеисследованиеструктурыхроматинаразныхуровнейорганизации: диссертация ... доктора биологических наук : 03.00.03. - Москва, 1999. - 258 с.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИй/сКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК Институт молекулярной биологии им. В.А.ЭнгельгардтаЭЛЕКТРОННОМИКРОСКОПИЧЕСКОЕИССЛЕДОВАНИЕСТРУКТУРЫХРОМАТИНАРАЗНЫХУРОВНЕЙОРГАНИЗАЦИИДиссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук молекулярная биология - 03.00.03 Москва 1999г 2 ОГЛАВЛЕНИЕ ВВЕДЕНИЕ ЦЕЛИ И ЗАДАЧИИССЛЕДОВАНИЯОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.ОРГАНИЗАЦИЯХРОМАТИНАУ ПРОКАРИОТ 2.СТРУКТУРАХРОМАТИНАИ МЕТАФАЗНЫХ...

стр. 50
50 2.3. ВысшиеуровниорганизациихроматинаПод высшимиуровнямиорганизациихроматинамы будем пониматьструктурыболее высокой, чем 20-30 нм фибриллы,организациихроматина. Биохимические данные в рамках простой трехуровневой моделиорганизациихромосом (Георгиев, Бакаев, 1978; Manuelidis, 1988, 1990;

Оглавление диссертациидоктор биологических наук Попенко, Владимир Иванович
ВВЕДЕНИЕ.
ЦЕЛИ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ II ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1. ОРГАНИЗАЦИЯ ХРОМАТИНА У ПРОКАРИОТ
2. СТРУКТУРА ХРОМАТИНА И МЕТАФАЗНЫХ ХРОМОСОМ ЭУКАРИОТ.
2Л. Нуклеосомный уровень организации хроматина.
2.1.2. Динамические возможности нукпеосом in vitro.
Температурная денатурация нуклеосом.
Разворачивание нуклеосом под действием мочевины.
Конформационные изменения нуклеосом в растворах с разной ионной силой.
Подвижность ДНК на октамере гистонов в кор-частицах.
2.1.3. HMG-белки и нукпеосомы.
2.1.4. Модифицированные гистоны в составе нуклеосом.
2.1.5. Варианты гистонов в составе нуклеосом.
2.1.6. Структура транскрипционно-активных участков генома.
2.2. 20-30 им фибриллы - наднуклеосомный уровень организации хроматина.
2.2.1. Компактизация нуклеосомных фибрилл в 20-30 нм фибриллы в растворе.
2.2.2. Модели организации 20-30 нм фибрилл.
Соленоидные" модели организации 20-30 нм фибрилл.
Нуклеомерная (супербидная) модель.
Модель "слоеного пирога".
Модели на основе "зиг-заг" структуры нуклеосомных фибрилл.
2.3. Высшие уровни организации хроматина.
2.3.1. Петельно-доменная организация хромосом.
Изучение участков геномной ДНК, связанной с ядерным матриксом) и интерфазным/метафазным скэффолдом (MARs/SARs).
Вырезание петель ДНКтопоизомеразой II ядерного матрикса.
2.3.2. Модели структурной организации метафазных хромосом.
Радиально-петельная модель и иерархия спиралей.
Модель дискретных уровней организации хромосом.
3. ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ХРОМАТИНА В ЯДРЕ. ГИПОТЕЗА "ХРОМОСОМНЫХ ТЕРРИТОРИЙ"
4. МАКРОНУКЛЕУС ИНФУЗОРИЙ КАК МОДЕЛЬ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ СТРУКТУРЫ ХРОМАТИНА
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
1. СТРУКТУРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИОННО-ТРАНСЛЯЦИОННОГО АППАРАТА АРХЕ- И ЭУБАКТЕРИЙ
1.1. Морфология клеток.
1.2. Морфология транскрипционных комплексов рибосомных и нерибосомных генов P.mirabilis и M.halophilus Z7952.
1.3. Структурная организация бактериальной хромосомы.
1.4. Распределение триптофанил-РНК-синтетазы в клетках эубактерий и архебактерий.
2. СТРУКТУРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ НЕАКТИВНОГО ХРОМАТИНА ЭУКАРИОТ НА УЛЬТРАТОНКИХ СРЕЗАХ И ВЫДЕЛЕННЫХ ПРЕПАРАТАХ.
3. СТРУКТУРА ТРАНСКРИПЦИОННО-АКТИВНОГО ХРОМАТИНА ЭУКАРИОТ
3.1. Рибосомные гены.
3.1.1. Транскрибируемые рибосомные гены на ультратонких срезах ядрышек.
3.1.2. Активность транскрипции ядрышек на различных стадиях созревания ооцитов.
3.1.3. Строение транскрипционных комплексов рибосомных генов.
3.1.4. Структура фибрилл хроматина в транскрибируемых и спейсерных участках.
3.2. Нерибосомные гены.
3.3. Упругие напряжения в транскрибируемом хроматине.
4. СТРУКТУРА МЕТАФАЗНЫХ ХРОМОСОМ
5. СТРУКТУРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ХРОМАТИНА МАКРОНУКЛЕУСА ИНФУЗОРИЙ.
5.1. Структура хроматина B.truncatella во время деления.
5.1.1. Макронуклеус клеток B.truncatella перед делением.
5.1.2. Зоны с различной морфологией хроматиновых глыбок в макронуклеусе инфузории B.truncatella.
5.1.3. Стадия конденсации макронуклеуса.
5.1.4. Стадии образования перетяжки, вытягивания макронуклеуса и молодых клеток.
5.2. Динамика формирования фибрилл типа хромонем в макронуклеусе
B.truncatella при переходе к стадии цисты.
5.3. Ассоциация хроматиновых глыбок в структуры более высокого уровня организации in vitro.
5.4. Структурная организация хромомеров макронуклеуса.
5.4.1. Размер ДНК в макронуклеусе B.truncatella.
5.4.2. Размер ДНК, упакованной в хромомерах макронуклеуса.
5.4.3. Визуализация центров организации хроматиновых глыбок.
5.5. Модель структурной организации хроматина макронуклеуса.
5.6. Хроматиновые глыбки макронуклеуса B.truncatella -структурно-функциональные аналоги хромомеров высших эукариот.
5.7. Сравнение динамики декомиактизации хромомеров in vivo и in vitro.
6. ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ХРОМАТИНА В ЯДРЕ. ГИПОТЕЗА "ХРОМОСОМНЫХ ТЕРРИТОРИЙ