Компьютерное конструирование трехмерной структуры цитохрома Р450 1А2 и поиск его потенциальных лигандов Белкина, Наталья Валерьевна

Короткий опис

Белкина,НатальяВалерьевна.КомпьютерноеконструированиетрехмернойструктурыцитохромаР4501А2ипоискегопотенциальныхлигандов: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.04. - Москва, 1999. - 97 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ МЕДИЦИНСКИХ НАУК НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ БИОМЕДИЦИНСКОЙ ХИМИИ На правах рукописиБЕЛКИНАНатальяВалерьевнаКОМПЬЮТЕРНОЕКОНСТРУИРОВАНИЕТРЕХМЕРНОЙСТРУКТУРЫЦИТОХРОМАР450 1А2 ИПОИСКЕГОПОТЕНЦИАЛЬНЫХЛИГАНДОВ03.00.04 - биохимия Диссера<а1Ц4я на соискание ученой степени

стр. 8
цитохромовР450. Аминокислотная определена организмов только для для последовательность видов различных ицитохромовР450 многих эукариотическихтрехмернаяцитохромовпрокариотических известна данныеструктур[Nelson, пяти при 1996], однакоструктураР450. Эти бактериальных используются моделированиитрехмерныхэукариотическихцитохромовР450. Одним является ферментом ответственен настоящее [Guengerich, кролика [Negishi, из наиболее...

стр. 13
помощью линейных групп. Докирование целой молекулы Другаялигандовв группа методов используется базах данных, содержащих дляпоискаструктурыпотенциальныхуже известных химических соединений. Для выполнения подобногопоискаиспользуют некоторую оценочную функцию, с помощью которой выявляютструктуракоторых наиболее комплементарна поверхностилиганды, белка. Затем отбирают наилучшие результаты с помощью различных оценки. Одной из самых ранних и

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Белкина, Наталья Валерьевна
ОГЛАВЛЕНИЕ
Список сокращений
Введение
Цель работы
Основные задачи работы
Обзор Литературы
Цитохром Р450 1А2
Создание новых лекарственных средств
Методы молекулярного докинга
Создание лигандов de novo
Локирование целой молекулы
Ограничения прямых методов
Методы типа QSAR
Методы CoMFA и CoMSIA
Ограничения непрямых методов
Материалы и методы
Аппаратная база работы
Программная база работы
Информационные ресурсы, использованные в работе
Моделирование трехмерной структуры CYP1A2
Оценка качества построения модели CYP1A2
Программа ERRAT
Программа PR0CHEK
Создание библиотек конформеров
Оптимизация комплекса двух молекул
Оптимизация конформации лиганда при поиске в базах данных
Процедура локирования - программа ОоскЭеагсЬ
Создание ОБАИ модели с использованием метода СоМБ1А
Создание корреляционных уравнений методом нейронных сетей
Результаты и обсуждение
Моделирование трехмерной структуры СУР1А2
Оценка качества построения модели СУР1А2
Моделирование комплексов СУР1А2 с кофеином и
7-этоксирезоруфином
Предсказание констант диссоциации
Использование нейронных сетей
Создание ЗБ-ОЗАЛ+СоМЗЬА модели
Скрининг баз данных
Выводы
Список литературы
Приложение 1