Исследование взаимодействия РНК- и ДНК-полимераз с матрицами и субстратами в водных и коллоидных растворах Анарбаев, Рашид Октамович

Краткое описание

Анарбаев,РашидОктамович.ИсследованиевзаимодействияРНК-иДНК-полимеразсматрицамиисубстратамивводныхиколлоидныхрастворах: диссертация ... кандидата химических наук : 03.00.04. - Новосибирск, 1999. - 144 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК С И Б И Р С К О Е ОТДЕЛЕНИЕ НОВОСИБИРСКИЙ ИНСТИТУТ БИООРГАНИЧЕСКОЙ ХИМИИ На правах рукописиАнарбаевРашидОктамовичИССЛЕДОВАНИЕВЗАИМ0ДЕЙСТВР1ЯРНК- И Д Ж - П О Л И М Е Р А З С МАТРРЩАМИ ИСУБСТРАТАМИВВОДНЫХИКОЛЛОИДНЫХРАСТВОРАХСпециальность: 03.00.04 - биохимия Диссертация

стр. 5
данногоисследования. Цель работы изучить механизмывзаимодействияРНКиДНК-полимеразсматрицамиисубстратамивводныхиколлоидныхрастворахтипа "вода

стр. 14
дезоксирибонуклеозид-5 '-трифосфатов. 1.4ДНК-полимеразаа 1.4.1ВзаимодействиеДНК-полимеразыа сматрицейДНК-полимеразаа связывает сначаламатрицу, затем праймер исубстрат. Хотя связывание праймера предшествует кинетически значимому связьшанию ёКТР, специфичность ферментаматрицыопределяется исключительно

Оглавление диссертациикандидат химических наук Анарбаев, Рашид Октамович
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ДНК-ПОЛИМЕР АЗА а-ДНК-ПРАЙМАЗА: СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ (ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР)
1.1 ДНК-ПОЛИМЕР АЗА а-ДНК-ПРАЙМАЗА IN VIVO
1.2 Структура комплекса ДНК-полимер аза а-ДНК-праймаза
1.3 ДНК-праймаза
1.4 ДНК-полимераза а
1.5 Точность ДНК-праймазы и ДНК-полимеразы а
ГЛАВА 2. Т7 РНК-ПОЛИМЕРАЗА (ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР)
2.1 Молекулярные свойства Т7 РНК-полимеразы
2.2 Структурно-функциональные свойства т7 РНК-полимеразы
2.3 Кристаллическая структура Т7 РНК полимеразы
2.4 Взаимодействие с промотором и стадия инициации
2.5 Биохимические свойства процесса элонгации транскрипта
2.6 Блокирование удлинения транскрипта
2.7 Необычные транскрипционные свойства т7 РНК-полимеразы
2.8 Модели структуры третичного комплекса и процесса элонгации транскрипта
2.9 Транскрипция РНК-матриц
2.10 "Беспромоторный" синтез РНК
2.11 Мутантные формы Т7 РНК-полимеразы
ГЛАВА 3. МИЦЕЛЛЯРНАЯ ЭНЗИМОЛОГИЯ (ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР)
3.1 Структура обращенных мицелл
3.2 Свойства воды в обращенных мицеллах
3.3 Межмицеллярный обмен
3.4 реакционная способность реагентов в обращенных мицеллах
3.5 Четыре важных для энзимологии свойства систем вода-ПАВ-органический растворитель
3.6 солюбилизация и свойства белков в обращенных мицеллах
3.7 влияние воды и растворителя на ферментативный катализ в обращенных мицеллах
3.8 вода, конформа1 (ионная ПОДВИЖНСЧЛЪ ферментов. И КАТАЛИЗ
3.9 взаимодействия и диссоциация белков в обращенных мицеллах
3.10 Свойства нуклеиновых кислот в обращенных мицеллах
3.11 Биологические структуры в обращенных мицеллах
3.12 Ферменты в жидкокристаллических мезофазах
ГЛАВА 4. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
4.1 ИССЛЕДОВАНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ДНК-ПРАЙМАЗЫ С МАТРИЦАМИ РАЗЛИЧНОЙ ДЛИНЫ И СТРУКТУРЫ
4.2 ИССЛЕДОВАНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ Т7 РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ С NTP И ИХ ПРОИЗВОДНЫМИ
4.3 ФРАГМЕНТ КЛЕНОВА И КОМПЛЕКС ДНК-ПОЛИМЕРАЗА а-ПРАЙМАЗА В ОБРАЩЕННЫХ
МИКРОЭМУЛЬСИЯХ РАЗЛИЧНОГО СОСТАВА
4.4 ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПТАЗА ВИЧ-1, ФРАГМЕНТ КЛЕНОВА, Т7 РНК-ПОЛИМЕРАЗА И ТТЕ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА В ОБРАЩЕННЫХ МИКРОЭМУЛЬСИЯХ
ГЛАВА 5. ИССЛЕДОВАНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ДИК-ПРАЙМАЗЫ С МАТРИЦАМИ РАЗЛИЧНОЙ ДЛИНЫ И СТРУКТУРЫ (РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ)
5.1 роль длины матрицы
5.2 Роль СТРУКТУРЫ МАТРИЦЫ
5.3 СИНТЕЗ ПРАЙМЕРОВ НА МАТРИЦАХ POLY(DT) И POLY(DC, DT)
5.4 кинетика синтеза РНК на матрице POLY(DT)
5.5 механистическая концепция синтеза PHK-праймера
ГЛАВА 6. ИССЛЕДОВАНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ Т7 РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ С NIT И ИХ ПРОИЗВОДНЫМИ (РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ)
6.1 квазистационарный подход к описанию синтеза РНК Т7 РНК-полимеразой
6.2 взаимодействие Т7 РНК-полимеразы с NTP
6.3 взаимодействие Т7 РНК-полимеразы с DNTP
6.4 взаимодействие Т7 РНК-полимеразы с аналогами СТР
ГЛАВА 7. ФРАГМЕНТ КЛЕНОВА И КОМПЛЕКС ДНК-ПОЛИМЕРАЗА а-ПРАЙМАЗА В ОБРАЩЕННЫХ МИКРОЭМУЛЬСИЯХ (РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ)___________________________________89
7.1 активность ДНК-полимер азы в АОТ, СТАВ, SDS и bru 58 обращенных микроэмульсиях
7.2 зависимость активности ДНК-полимеразы от состава микроэмульсий
7.3 ЗАВИСИМОСТЬ АКТИВНОСТИ ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ ОТ КОНЦЕНТРАЦИИ MGAC2, ТРИС-АС И РН
7.4 Зависимость активности ДНК-полймеразы и совместной активности ДНК-полимеразы а-
праймазы от wc
7.5 процессивность ДНК-полимеразы в обращенных микроэмульсиях
7.6 процессивность ДНК-полимеразы при высоких концентрациях воды
7.7 ОСОБЕННОСТИ СОСТАВА ОБРАЩЕННЫХ МИКРОЭМУЛЬСИЙ
ГЛАВА 8. ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПТАЗА ВИЧ-1, ФРАГМЕНТ КЛЕНОВА, Т7 РНК-ПОЛИМЕРАЗА И ТТЕ ДНК-ПОЛИМЕРАЗА В ОБРАЩЕННЫХ МИКРОЭМУЛЬСИЯХ (РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ)
8.1 повышение ферментативной активности с помощью щелочных агентов
8.2 фрагмент кленова в обращенных микроэмульсиях
8.3 тте днк-полимераза В обращенных микроэмульсиях
8.4 обратная транскриптаза ВИЧ-1 в обращенных микроэмульсиях
8.5 Т7 РНК-полимераза в обращенных микроэмульсиях
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ