Межмолекулярное узнавание в глобулярных белках Брукхейвенского банка данных Линде, Дмитрий Михайлович

Краткое описание

Линде,ДмитрийМихайлович.МежмолекулярноеузнаваниевглобулярныхбелкахБрукхейвенскогобанкаданных: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.04. - Москва, 1999. - 121 с.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ МЕДИЦИНСКР1Х НАУК НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ БИОМЕДИЦИНСКОЙ ХИМИИ На правах рукописи УДК 577.15ЛиндеДмитрияМихайловичаМежмолекулярноеузнаваниевглобулярныхбелкахБрукхейвенскогобанкаданных(специальность 03.00.04 - биологическая химия) Научные руководители: доктор

стр. 7
объясняющей матрицы комплементарности, контактов в структуру наблюдаемыхбелкахизБрукхейвенскогобанкаданных. ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.Межмолекулярноеузнавание: определение^ роль в функции и структурообразовании Термины ^молекулярное взаимодействие' '*межмолекулярноеузнавание' применяются иузнавание' , ^межмолекулярноефизико- для описания химических процессов, протекающих в биологических системах...

стр. 46
белковых комплексов, возрастает продуктов, также количество программных позволяющих проводить исследования и анализ закономерностей,межмолекулярногоопределяющих особенностиузнаваниявбелках. Лаборатория Bioinformatics реляционнуюбелковданныхтолько на базу основе The E B I MSD InstituteданныхданныхGroup of European разрабатывает структурбанкачетвертичныхБрукхейвенскогоИнтернет по [Jones, 1997]. В сети доступна адресу...

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Линде, Дмитрий Михайлович
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. Межмолекулярное узнавание. Определение, 7 роль в функции и структурообразовании.
2. Норма и патология.
3. Типы межмолекулярного узнавания, силы его 10 стабилизирующие, аффинность и специфичность узнавания.
4. Данные рентгеноструктурного анализа 2 4 белковых молекул. Внутри- и межмолекулярное узнавание.
5. Концепция о существовании общего 34 стереохимического генетического кода Меклера и гипотеза о комплементарности пептидов.
6. Ресурсы компьютерной сети Интернет по 4 6 молекулярному узнаванию.
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1. Описание выборки контактов для негомологичных белковых комплексов из Брукхейвенского банка данных
2. Создание реляционной базы данных для 61 изучения контактных участков в белках.
3. Тестирование работы программного 7 0 обеспечения на примере молекулы лизоцима.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
1. Анализ аминокислотного состава контактных 75 областей белков исследуемой выборки.
2. Распределение пар аминокислотных остатков 83 в контактах белковых комплексов. Анализ физико-химических свойств аминокислотных остатков в межбелковом взаимодействии.
3. Сравнительный анализ пар аминокислот, 86 встречающихся в межмолекулярных и внутримолекулярных контактах.
4. Сравнение наблюдаемых частот 92 встречаемости пар аминокислотных остатков в контактах с ожидаемыми на основе гипотез о кодах комплементарности.
5. Анализ наблюдаемого в белках минимального 92 числа контактов, определяющего стереоспецифичность межмолекулярного узнавания.
6. Поиск универсального кода 96 комплементарности аминокислотных остатков.
ВЫВОДЫ