Симметричные структуры в нуклеотидных последовательностях сайтов инициации репликации ДНК прокариот Акберова, Наталья Ивановна

Краткое описание

Акберова,НатальяИвановна.СимметричныеструктурывнуклеотидныхпоследовательностяхсайтовинициациирепликацииДНКпрокариот: диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.04. - Казань, 1999. - 126 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
КАЗАНСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ На правах рукописиАКБЕРОВАНАТАЛЬЯИВАНОВНАСИММЕТРИЧНЫЕСТРУКТУРЫВНУКЛЕОТИДНЫХПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХСАЙТОВИНИЦИАЦИИРЕПЛИКАЦИИДНКПРОКАРИОТСпециальность: 03 00 04 - биохимия Диссертация у на соискание ученой степени кандидата биологических наук Научные руководители:

стр. 7
такой симметрийный подход применяется для исследования генетических текстов .сайтовинициациирепликации8Прокариоти предлагается метод построения симметрийных консенсусов для изучения первичнойструктурыorí. Интерес именно к первичнойструктуресайтаинициациирепликацииобъясняется тем, чтонуклеотидные

стр. 9
(аминокето) Показана значимость для функции oríсимметричныхструктур, выявленных внуклеотидныхпоследовательностяхрепликацииДНКпрокариот.сайтовинициацииПрактическая ценность: Предложен конгекстно-независимый метод анализануклеотидныхпоследовательностей, основанный на внутренней симметрии генетического

Оглавление диссертациикандидат биологических наук Акберова, Наталья Ивановна
СОДЕРЖАНИЕ
стр.
5
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Структура сайтов инициации репликации ДНК
1.2. Методы исследования генетических текстов функциональных сайтов
ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ
2.1 ОБЪЕКТЫ
2.2 МЕТОДЫ
2.2.1. метод анализа симметрии генетического текста
2.2.2. метод оценки значимости выявленных элементов симметрии для функции оп
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1.Симметричные структуры в нуклеотидных последовательностях прокариотических оп
3.2. Классификация изучаемых последовательностей, основанная на вхождение в них симметричных структур
3.2.1.Классификация множества генетических текстов по признаку вхождения симметричных структур
3.2.2. Соответствие классификации изучаемых последовательностей, основанной на вхождение в них симметричных структур, содержательным классификациям
3.3.Построение симметрийных консенсусов оп
3.3.1. Симметрийный консенсус для последовательностей группы
E.coli
3.3.2. Сравнение симметрийного консенсуса с экспериментальными данными о строении ori
3.3.2.1.Сайты связывания с белками, участвующими в инициации репликации ДНК
3.3.2.2. В симметрийные консенсусы входят все типы экспериментально обнаруженных структурных элементов ori прокариот
3.3.3. Симметрийный консенсус для последовательностей рода Pseudomonas
3.3.4. Сравнение симметрийных консенсусов, построенных для последовательностей группы E.coli и последовательностей рода Pseudomonas. 74 3.4. Использование симметриных консенсусов для распознавания ori 76 3.4.1 .«Экспериментальный» образ ori 77 3.4.2. «Формальный» образ ori
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ЛИТЕРАТУРА
ПРИЛОЖЕНИЕ
116