Некоторые вопросы теории фазовых переходов в биологических макромолекулах Шахнович, Евгений Исаакович

Короткий опис

Шахнович,ЕвгенийИсаакович.Некоторыевопросытеориифазовыхпереходоввбиологическихмакромолекулах: диссертация ... кандидата физико-математических наук : 03.00.03. - Пущино, 1984. - 181 с. : ил.больше
Цитаты из текста:

стр. 1
e/zfr- //rr^ ~'.^ АКАДЕМИЯ НАУК СССР ИНСТИТУТ БЕЛКА На правах рукописи УДК 547.199 ШАШОВИЧЕвгенийИсааковичНЕКОТОРЫЕВОПРОСЫТЕОРИИФАЗОШХПЕРЕХОДОВВ БИ0Л01МЕС1ШХМАКРОМОЛЕКУЛАХ03.00,03 "Молекулярная биология" Диссертация на соискание ученой степени кандидата физикочугатематических наук Научные руководители:

стр. 2
Глобулярное состояние жесткихмакромолекул. . 34 Д. Структура и самоорганизация белковых глобул . . 38 3 § 5.Переходыклубок-глобула вмакромолекулахА. Терминология дляфазовыхпереходовв конечных системах Б.Фазовыепереходыв больших глобулах § 6.Фазовыепереходыв биополимерах А. Денатурация

стр. 7
фазовыхпереходов. 8 Кроме этого,фазовыепереходывбиологическихмакромолеку­ лахтесно связаны с явлением их самоорганизации. В силу этого, понимание свойств такихфазовыхпереходовпредставляется в настоя­ щее время естественным путем к теоретическому пониманию всего комплекса проблем, связанных со структурой

Оглавление диссертациикандидат физико-математических наук Шахнович, Евгений Исаакович
ВВВДЕНИЕ.
A. Актуальность темы работы
Б. Предмет работы.
B. Содержание работы .Ю
ГЛАВА I. ОБЗОР ОСНОВНЫХ ПРЕДСТАВЛЕНИЙ СОВРЕМЕННОЙ
ТЕОРИИ БИОПОЛИМЕРНЫХ СИСТЕМ .Ц
§ I. Предварительные замечания .II
A.Полимер как частично равновесная система . ц Б. Распределение Гиббса для полимерной цепи
B. Понятие & -температуры.
Г. Макроскопические состояния полимерной цепи
§ 2. Модели полимерной цепи
A. Модель бусиной.
Б. Макромолекулы из чередующихся жестких и гибких участков
B. Персистентная модель
§ 3. Полимерные растворы в хороших растворителях
А. Приближение самосогласованного поля модель Флори-Хаггинса
Б. Скейлинговые законы для хороших растворителей
§ 4. Объемные взаимодействия в полимерных глобулах
A. Метод самосогласованного поля.
Б. Конфигурационная энтропия полимерной глобулы
B. Структура большой глобулы .32 '
Г. Глобулярное состояние жестких макромолекул
Д. Структура и самоорганизация белковых глобул
§ 5. Переходы клубок-глобула в макромолекулах.
А. Терминология для фазовых переходов в конечных системах.
Б. Фазовые переходы в больших глобулах
§ 6. Фазовые переходы в биополимерах.
А. Денатурация глобулярных белков.
Б. Другие фазовые переходы в белках.
С. Переходы клубок-глобула в ДНК.
§ 7. Постановка основных задач работы.
ГЛАВА П. ТЕОРИЯ ДЕНАТУРАЦИИ ГЛОБУЛЯРНЫХ БЕЛКОВ.
§ I. Постановка задачи.
§ 2. Модель белковой глобулы
§ 3. Простые модели систем с полимерными и неполимерными степенями свободы
А. Коллективные движения.
Б. Термодинамика системы частиц упруго связанных с твердыми поверхностями
§ 4. Анализ взаимодействий в белковой глобуле
A. Ван-дер-ваальсовы взаимодействия в гидрофобном ядре.
Б. Гидрофобные взаимодействия.
B. Энтропия колебаний боковых групп
Г. Электростатические взаимодействия
§ 5. Уравнение состояния белковой глобулы
§ 6. Фазовые переходы нативная глобула - расплавленная глобула.
§ 7. Диаграмма состояний белковой глобулы
§ 8. Сравнение результатов теории с экспериментальными данными.
§ 9. Обсуждение результатов.
ГЛАВА Ш. ТЕОРИЯ ПЕРЕХОДОВ КЛУБОК-ГЛОБУЛА В БИОПОЛИМЕРАХ, НАХОДЯЩИХСЯ В СЛОЖНОМ НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНОМ РАСТВОРИТЕЛЕ.
§ I. Постановка вопроса.
§ 2. Переходы клубок-глобула в случае, когда компоненты растворителя смешиваются при всех концентрациях . . . П
§ 3. Переходы клубок-глобула в , :случае, когда растворитель может расслаиваться на фазы.
§ 4. Обсуждение результатов.
ГЛАВА 1У. ТЕОРИЯ КОМПАКТИЗАЩИ ДНК В СЛОЖНОМ ПОЛИМЕРНОМ
РАСТВОРИТЕЛЕ.
§ I. Постановка задачи.
А. Предварительные замечания
Б. Описание используемой модели.
§ 2. Элементарное рассмотрение глобулы ДНК в разбавленном растворе ПЭГ.
§ 3. Качественное объяснение компактизации.
§ 4. Вычисление химического потенциала звена ДНК
§ 5. Эффективное вириальное разложение
§ 6. Образование глобулы ДНК в разбавленном растворе
§ 7. О пределах применимости изложенной теории в области разбавленного раствора
§ 8. Об условиях существования глобулярной (компактной
ДНК) в полуразбавленном растворе ПЭГ.
§9.0 внутримолекулярном ориентационном упорядоточении сегментов ДНК.
§10. О зависимости свойств системы от ионной силы раствора.
§11. Краткое сравнение результатов теории с данными эксперимента
ВЫВОДЫ.